91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_38450 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  40.17 
 
 
1422 aa  937    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  42.67 
 
 
944 aa  742    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  100 
 
 
1427 aa  2969    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  29.87 
 
 
1077 aa  117  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  28.32 
 
 
797 aa  112  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  28.19 
 
 
795 aa  111  9.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  26.76 
 
 
633 aa  105  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  28.72 
 
 
1090 aa  105  9e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  26.01 
 
 
1999 aa  103  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  23.6 
 
 
716 aa  102  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  27.11 
 
 
633 aa  102  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  28.9 
 
 
611 aa  99.8  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  26.06 
 
 
633 aa  99.8  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  27.01 
 
 
2310 aa  97.8  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  31.11 
 
 
622 aa  97.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  23.25 
 
 
1189 aa  97.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  23.66 
 
 
655 aa  97.1  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  30.74 
 
 
619 aa  95.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  27.74 
 
 
479 aa  93.2  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  25.35 
 
 
633 aa  92  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  29.7 
 
 
622 aa  92  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  26.52 
 
 
2245 aa  90.1  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  26.09 
 
 
754 aa  90.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  25.67 
 
 
388 aa  87  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  28.83 
 
 
315 aa  85.9  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  22.65 
 
 
650 aa  85.5  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  29.29 
 
 
651 aa  85.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  22.65 
 
 
650 aa  85.1  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  26.88 
 
 
268 aa  84.7  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  26.58 
 
 
636 aa  85.1  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  25.95 
 
 
636 aa  81.6  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  24.29 
 
 
635 aa  81.6  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  26.11 
 
 
632 aa  81.6  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  23.49 
 
 
1620 aa  81.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  24.92 
 
 
466 aa  79.3  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  24.57 
 
 
609 aa  77.4  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  27.55 
 
 
1097 aa  77  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  26.49 
 
 
643 aa  73.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  25.76 
 
 
941 aa  73.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  24.31 
 
 
553 aa  73.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  24.31 
 
 
553 aa  73.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  23.81 
 
 
1653 aa  72.4  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  26.42 
 
 
1099 aa  70.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  25.44 
 
 
1048 aa  70.1  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  23.15 
 
 
715 aa  70.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  25.91 
 
 
986 aa  70.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  22.24 
 
 
464 aa  68.9  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  23.7 
 
 
902 aa  68.6  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  22.45 
 
 
1284 aa  67.8  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.08 
 
 
752 aa  67  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  23.87 
 
 
1111 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  23.61 
 
 
1108 aa  67.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25.8 
 
 
606 aa  66.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  22.42 
 
 
748 aa  66.6  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  25 
 
 
902 aa  66.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  26.62 
 
 
952 aa  65.5  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  24.12 
 
 
1585 aa  64.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  24.12 
 
 
1585 aa  64.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  25.31 
 
 
486 aa  63.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  25 
 
 
901 aa  62.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  23.86 
 
 
934 aa  62.4  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  24.44 
 
 
686 aa  62  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  24.05 
 
 
1018 aa  61.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  25.08 
 
 
521 aa  60.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  23.51 
 
 
629 aa  60.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  27.91 
 
 
1190 aa  60.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  24.06 
 
 
585 aa  57.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  24 
 
 
1408 aa  58.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  24.73 
 
 
2207 aa  57  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.78 
 
 
1428 aa  56.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  24.91 
 
 
1803 aa  55.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  25.74 
 
 
1041 aa  53.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  21.02 
 
 
759 aa  52  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  28.48 
 
 
1212 aa  52  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  23.64 
 
 
659 aa  51.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  24.39 
 
 
1651 aa  50.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  21.37 
 
 
1284 aa  50.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.82 
 
 
254 aa  49.3  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  32.56 
 
 
237 aa  49.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  28.49 
 
 
1175 aa  47.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  20.88 
 
 
283 aa  47  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  24.4 
 
 
1038 aa  47  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  23.97 
 
 
297 aa  46.2  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.71 
 
 
732 aa  46.2  0.004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  30.94 
 
 
2222 aa  46.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  24.47 
 
 
1945 aa  45.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  24.7 
 
 
1790 aa  45.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  25.51 
 
 
2198 aa  45.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49919  predicted protein  28 
 
 
1040 aa  45.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.099413  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  36.62 
 
 
1571 aa  45.1  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68531  predicted protein  28.57 
 
 
1114 aa  45.1  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.134601  normal  0.0417383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>