239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1346 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  100 
 
 
203 aa  419  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.26 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  28.4 
 
 
292 aa  65.1  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  31.86 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 
147 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
154 aa  53.9  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 
151 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
182 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
158 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 
173 aa  52.4  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
168 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
267 aa  52  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
145 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
145 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
146 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 
159 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
153 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
172 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
172 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  30.67 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
150 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
158 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
140 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
150 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
150 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  40.26 
 
 
150 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
139 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
150 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
158 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
145 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 
159 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  43.55 
 
 
161 aa  49.3  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
150 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
150 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
150 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
139 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
151 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 
160 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
151 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
163 aa  48.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
151 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
149 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  29.09 
 
 
261 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 
163 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
152 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
150 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  46 
 
 
150 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
149 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 
203 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  26.44 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  40.68 
 
 
153 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 
219 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
138 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
167 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  23 
 
 
160 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  27.63 
 
 
159 aa  47  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  23 
 
 
160 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  23 
 
 
160 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  23 
 
 
160 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  38.71 
 
 
157 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
154 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
148 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  23 
 
 
160 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  28.21 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
411 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.55 
 
 
311 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  23 
 
 
160 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  23 
 
 
160 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 
150 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 
141 aa  46.6  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  23 
 
 
160 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
144 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
150 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  31.37 
 
 
160 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 
154 aa  45.8  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
157 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 
143 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
165 aa  46.2  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
150 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  30.84 
 
 
166 aa  45.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  38.46 
 
 
166 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
181 aa  45.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
314 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  30.12 
 
 
144 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>