More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0610 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  51.39 
 
 
722 aa  716    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  50.97 
 
 
722 aa  715    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  51.1 
 
 
722 aa  717    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.28 
 
 
716 aa  689    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  51.52 
 
 
722 aa  719    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  49.58 
 
 
718 aa  670    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.86 
 
 
713 aa  677    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 
727 aa  1473    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  51.39 
 
 
724 aa  716    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  51.39 
 
 
724 aa  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  51.39 
 
 
724 aa  716    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.77 
 
 
712 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  49.24 
 
 
718 aa  662    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.76 
 
 
722 aa  684    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  51.52 
 
 
724 aa  723    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.52 
 
 
716 aa  699    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  51.39 
 
 
722 aa  715    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.9 
 
 
722 aa  663    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.8 
 
 
722 aa  711    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  47.32 
 
 
718 aa  642    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.52 
 
 
716 aa  699    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  46.94 
 
 
720 aa  645    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  46.8 
 
 
720 aa  646    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.76 
 
 
722 aa  713    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.86 
 
 
713 aa  674    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.86 
 
 
713 aa  677    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  51.04 
 
 
728 aa  674    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  50.9 
 
 
721 aa  700    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  51.66 
 
 
722 aa  716    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.12 
 
 
724 aa  648    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  50.14 
 
 
721 aa  672    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.09 
 
 
720 aa  615  1e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  44.12 
 
 
717 aa  609  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  46.77 
 
 
730 aa  605  9.999999999999999e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  45.41 
 
 
762 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.44 
 
 
726 aa  593  1e-168  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  45.99 
 
 
713 aa  586  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  43.29 
 
 
736 aa  588  1e-166  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  46.16 
 
 
721 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  45.96 
 
 
710 aa  580  1e-164  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  44.49 
 
 
761 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  44.61 
 
 
759 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  43.35 
 
 
765 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.46 
 
 
780 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  42.68 
 
 
773 aa  572  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  44.13 
 
 
779 aa  569  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.92 
 
 
706 aa  572  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  44.38 
 
 
757 aa  569  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  42.74 
 
 
766 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  43.65 
 
 
787 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0173  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.3 
 
 
804 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  43.59 
 
 
760 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  43.99 
 
 
705 aa  567  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  41.87 
 
 
773 aa  565  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  43.28 
 
 
802 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  42.97 
 
 
799 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  43.75 
 
 
777 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  42.72 
 
 
777 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  42.66 
 
 
782 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  43.75 
 
 
788 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.66 
 
 
723 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  44.11 
 
 
754 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  44.68 
 
 
720 aa  561  1e-158  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3982  hypothetical protein  43.28 
 
 
791 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  42.53 
 
 
781 aa  561  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3743  hypothetical protein  43.28 
 
 
791 aa  561  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  44.21 
 
 
754 aa  559  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0170  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.28 
 
 
791 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3508  hypothetical protein  43.81 
 
 
778 aa  561  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631069  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  43.67 
 
 
773 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.62 
 
 
757 aa  558  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  43.52 
 
 
762 aa  558  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  43.6 
 
 
774 aa  555  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  43.6 
 
 
774 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  43.6 
 
 
774 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  43.58 
 
 
821 aa  555  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  43.6 
 
 
774 aa  555  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1079  Tex-like protein protein-like protein  42.64 
 
 
704 aa  554  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.12 
 
 
787 aa  555  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  43.6 
 
 
774 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  43.84 
 
 
756 aa  552  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  43.6 
 
 
774 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  43.23 
 
 
772 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  44.07 
 
 
779 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.38 
 
 
813 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.73 
 
 
774 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  43.27 
 
 
774 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.61 
 
 
777 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  41.88 
 
 
772 aa  548  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3702  putative transcriptional accessory protein  42.47 
 
 
776 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1476  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.05 
 
 
812 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0738998 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  41.46 
 
 
767 aa  548  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3705  putative transcriptional accessory protein  42.47 
 
 
776 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.43 
 
 
787 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.38 
 
 
774 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1942  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.25 
 
 
778 aa  549  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0410513  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4965  putative transcription accessory protein  41.81 
 
 
796 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0767  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.58 
 
 
720 aa  545  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.02 
 
 
787 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  43.11 
 
 
815 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>