More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4115 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4115  inner-membrane translocator  100 
 
 		 287 aa  547  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7596  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.96 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6454  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0183662  hitchhiker  0.00000000352666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.82 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 287 aa  115  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0562  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.56 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000395918  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.179629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  31.29 
 
 		 542 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6136  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0756138  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 551 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2284  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.2 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.51 
 
 		 550 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4104  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  29.63 
 
 		 545 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  28.37 
 
 		 547 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  29.35 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 300 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 628 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  28.76 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  30.93 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.85 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  27.72 
 
 		 534 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 526 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 288 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  32.43 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  28.38 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 554 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.33 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  27.42 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  27.42 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  27.42 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  27.42 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  29.6 
 
 		 548 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  28.15 
 
 		 540 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  28.94 
 
 		 542 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  33 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  27.96 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0116  inner-membrane translocator  27.12 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  28.76 
 
 		 524 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  32.6 
 
 		 290 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  29.39 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4018  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 639 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.85 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 542 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  29.09 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3367  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 287 aa  99.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  32.67 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.58 
 
 		 545 aa  99  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 289 aa  99  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 524 aa  99  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2166  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  34.96 
 
 		 285 aa  99  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.18 
 
 		 537 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 537 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.55 
 
 		 558 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  27.74 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3725  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0553822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2331  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.729625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 382 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.2 
 
 		 603 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  26.85 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  28.41 
 
 		 515 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 603 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 537 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3536  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0293486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 652 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 603 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>