More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0116 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0116  inner-membrane translocator  100 
 
 		 294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 292 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 288 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 283 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0994  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 642 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  31.54 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4018  inner-membrane translocator  32.64 
 
 		 639 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2331  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 300 aa  122  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.729625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0300  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  30.65 
 
 		 642 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247535  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1944  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 642 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.11 
 
 		 523 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  28.92 
 
 		 295 aa  118  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 551 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  32.64 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.31 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  30 
 
 		 524 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  30.17 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  28.72 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  30 
 
 		 526 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.38 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 540 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  31.46 
 
 		 542 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  29.31 
 
 		 526 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  29.31 
 
 		 524 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0802  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 534 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  29.55 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0852  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.64 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  29.21 
 
 		 515 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.62 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  28.18 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5641  inner-membrane translocator  29.31 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  29.66 
 
 		 528 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 527 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  27.59 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  27.59 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.43 
 
 		 545 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 308 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  30.13 
 
 		 548 aa  108  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 319 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 319 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.88 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.9 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  30.56 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.56 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.76 
 
 		 558 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 547 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  27.97 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3399  inner-membrane translocator  29.22 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0589  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 500 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.892329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  28.06 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.47 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  30.23 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  28.32 
 
 		 292 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.19 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 652 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 542 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1797  inner-membrane translocator  28.47 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4054  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 554 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 542 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2270  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1601  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.07 
 
 		 537 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  30.27 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  30 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  30.36 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>