More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2925 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 		 536 aa  1066    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  60.73 
 
 		 508 aa  596  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  65.17 
 
 		 489 aa  595  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  50.95 
 
 		 498 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  53.28 
 
 		 513 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  51.8 
 
 		 521 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  52.89 
 
 		 506 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  49.3 
 
 		 518 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  50.1 
 
 		 521 aa  444  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  47.77 
 
 		 504 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  49.9 
 
 		 521 aa  444  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  50 
 
 		 518 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  44.99 
 
 		 551 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  41.75 
 
 		 511 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  32.67 
 
 		 554 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  32.67 
 
 		 554 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  33.96 
 
 		 546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  30.9 
 
 		 549 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  33.12 
 
 		 544 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  30.77 
 
 		 551 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  30.77 
 
 		 551 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  30.71 
 
 		 551 aa  253  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  32.05 
 
 		 546 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  32.43 
 
 		 515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  31.77 
 
 		 513 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  30.09 
 
 		 527 aa  230  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  30.95 
 
 		 568 aa  224  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  30.95 
 
 		 568 aa  224  4e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  30.45 
 
 		 565 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  30.37 
 
 		 568 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  31.8 
 
 		 561 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  29.97 
 
 		 566 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  35.38 
 
 		 497 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3235  multicopper oxidase type 2  34.09 
 
 		 502 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  33.26 
 
 		 504 aa  211  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  31.12 
 
 		 563 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  27.73 
 
 		 705 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  33.41 
 
 		 483 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  32.5 
 
 		 556 aa  193  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  44.19 
 
 		 545 aa  190  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  34.91 
 
 		 499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  29.84 
 
 		 576 aa  181  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  36.79 
 
 		 656 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  42.19 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  32.56 
 
 		 601 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  34.82 
 
 		 594 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  32.64 
 
 		 601 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  29.87 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  29.87 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  34.95 
 
 		 664 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  30.72 
 
 		 476 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  33.96 
 
 		 621 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  38.16 
 
 		 584 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  30.25 
 
 		 589 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  35.13 
 
 		 593 aa  162  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  32.02 
 
 		 669 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  31.94 
 
 		 605 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  31.82 
 
 		 580 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  31.76 
 
 		 619 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  32.82 
 
 		 621 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3408  multicopper oxidase type 2  36.63 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  33.44 
 
 		 592 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  30.42 
 
 		 638 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  33.63 
 
 		 606 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  34.81 
 
 		 590 aa  157  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  32.72 
 
 		 606 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  33.33 
 
 		 607 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  31.41 
 
 		 652 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  32.62 
 
 		 604 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  31.41 
 
 		 671 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  31.41 
 
 		 652 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  34.2 
 
 		 574 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  32.48 
 
 		 809 aa  154  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  32.52 
 
 		 673 aa  154  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  31.84 
 
 		 606 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  33.86 
 
 		 637 aa  153  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  32.68 
 
 		 642 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  32.68 
 
 		 672 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  34.74 
 
 		 579 aa  151  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  27.32 
 
 		 457 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  35.42 
 
 		 611 aa  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  27.14 
 
 		 457 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  34.32 
 
 		 572 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  31.91 
 
 		 633 aa  150  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  31.78 
 
 		 598 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  32.35 
 
 		 657 aa  150  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  34.35 
 
 		 606 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  30.66 
 
 		 946 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  31.23 
 
 		 605 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  33.06 
 
 		 599 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  27.99 
 
 		 460 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  30.77 
 
 		 630 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  32.69 
 
 		 664 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  30.48 
 
 		 627 aa  146  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  28.97 
 
 		 941 aa  146  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  30.79 
 
 		 604 aa  146  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  31.41 
 
 		 666 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  30.98 
 
 		 604 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  29.76 
 
 		 746 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  31.49 
 
 		 640 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>