More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2020 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2020  ABC transporter related  100 
 
 		 353 aa  687    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  50.91 
 
 		 384 aa  318  9e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  55.77 
 
 		 351 aa  305  6e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  54.99 
 
 		 357 aa  292  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  50.43 
 
 		 352 aa  289  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  51 
 
 		 352 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  48.42 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  46.7 
 
 		 396 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  47.24 
 
 		 398 aa  276  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  51.58 
 
 		 349 aa  275  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  48.14 
 
 		 359 aa  271  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  43.86 
 
 		 344 aa  265  8.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  46.99 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  48.08 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  48.41 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  43.18 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  43.43 
 
 		 346 aa  259  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  50 
 
 		 349 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  45.38 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  49.71 
 
 		 349 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  49.71 
 
 		 349 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  45.48 
 
 		 348 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  43.77 
 
 		 345 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  52.1 
 
 		 350 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  44.51 
 
 		 345 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  43.75 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  49.39 
 
 		 342 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  41.55 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  41.55 
 
 		 349 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 349 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  47.44 
 
 		 346 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  44.07 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1666  ABC transporter related  48.72 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022862  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.33 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  44.41 
 
 		 369 aa  230  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  44.44 
 
 		 369 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  42.73 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  44.41 
 
 		 369 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  51.42 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  43.81 
 
 		 347 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  44.44 
 
 		 369 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  42.26 
 
 		 358 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  46.15 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7419  ABC transporter related  50.3 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  40.18 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  45.68 
 
 		 352 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  41.41 
 
 		 369 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  42.36 
 
 		 361 aa  222  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 		 353 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  42.66 
 
 		 368 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.37 
 
 		 366 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1735  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.95 
 
 		 368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000353928 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  44.19 
 
 		 363 aa  219  5e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  46.2 
 
 		 387 aa  219  7e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 387 aa  219  7.999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  48.08 
 
 		 364 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  39.55 
 
 		 371 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.95 
 
 		 371 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  44.81 
 
 		 357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  42.42 
 
 		 344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.91 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  42.32 
 
 		 375 aa  216  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  46.18 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1611  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 381 aa  216  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 330 aa  215  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.93 
 
 		 353 aa  215  9e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 		 364 aa  215  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  38.85 
 
 		 318 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  44.63 
 
 		 369 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  38.85 
 
 		 318 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  37.33 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  45.15 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  38.14 
 
 		 362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 		 330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  38.98 
 
 		 364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.61 
 
 		 353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  44.58 
 
 		 357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.28 
 
 		 359 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  39.6 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.07 
 
 		 370 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0669112  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  40.29 
 
 		 356 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  42.6 
 
 		 353 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  44.25 
 
 		 341 aa  212  9e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  38.72 
 
 		 343 aa  212  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  45.63 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1571  ABC transporter, ATP-binding protein  38.22 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  36.47 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3927  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.38 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  41.47 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.98 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  42.45 
 
 		 358 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  39.83 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.78 
 
 		 377 aa  210  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 371 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>