118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1333 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  100 
 
 		 799 aa  1623    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  55.8 
 
 		 789 aa  780    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  40.37 
 
 		 779 aa  484  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  40.18 
 
 		 779 aa  475  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  38.76 
 
 		 795 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  38.14 
 
 		 762 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  37.6 
 
 		 795 aa  432  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  38.07 
 
 		 760 aa  429  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  36.64 
 
 		 814 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  36.46 
 
 		 804 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  37.02 
 
 		 795 aa  412  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  35.75 
 
 		 816 aa  405  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  35.89 
 
 		 819 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  38.4 
 
 		 773 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  34.94 
 
 		 778 aa  392  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  36.18 
 
 		 805 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  33.29 
 
 		 842 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  35.37 
 
 		 772 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  34.8 
 
 		 779 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  34.94 
 
 		 737 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  35.31 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  35.56 
 
 		 763 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  35.73 
 
 		 770 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  35.4 
 
 		 769 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  33.25 
 
 		 793 aa  347  5e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  32.5 
 
 		 824 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  30.87 
 
 		 854 aa  298  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  30.09 
 
 		 855 aa  296  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  29.31 
 
 		 854 aa  294  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  29.43 
 
 		 854 aa  293  9e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  29.78 
 
 		 860 aa  289  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  30.26 
 
 		 841 aa  289  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  29.79 
 
 		 855 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  29.79 
 
 		 855 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.89 
 
 		 855 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  28.21 
 
 		 852 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  23.29 
 
 		 708 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  23.12 
 
 		 674 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  25.12 
 
 		 694 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  24.45 
 
 		 718 aa  110  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.76 
 
 		 724 aa  95.9  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  23.82 
 
 		 725 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  26.93 
 
 		 712 aa  91.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.69 
 
 		 701 aa  70.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  27.56 
 
 		 818 aa  68.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  27.93 
 
 		 770 aa  67.4  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  25.04 
 
 		 827 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  26.39 
 
 		 827 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3996  peptidase S45 penicillin amidase  29.8 
 
 		 947 aa  64.7  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  22.82 
 
 		 792 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4037  peptidase S45 penicillin amidase  29.41 
 
 		 947 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  22.24 
 
 		 808 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3892  penicillin amidase  29.18 
 
 		 947 aa  61.2  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  22.83 
 
 		 818 aa  61.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  27.45 
 
 		 769 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  28.62 
 
 		 813 aa  60.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  26.51 
 
 		 795 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  27.44 
 
 		 810 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  25.11 
 
 		 809 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  22.75 
 
 		 847 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  24.18 
 
 		 809 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  27.3 
 
 		 821 aa  57.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  23.16 
 
 		 848 aa  56.6  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  22.19 
 
 		 760 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  26.37 
 
 		 806 aa  57  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  21.48 
 
 		 809 aa  55.1  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2556  penicillin amidase  28.62 
 
 		 702 aa  55.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102799  normal  0.386886 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  27.73 
 
 		 693 aa  55.1  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0427638 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  23.29 
 
 		 761 aa  54.7  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  21.94 
 
 		 795 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  22.92 
 
 		 782 aa  54.3  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  25.38 
 
 		 821 aa  53.5  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  22.84 
 
 		 783 aa  53.9  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  21.67 
 
 		 787 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  39.56 
 
 		 829 aa  53.5  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  20.03 
 
 		 795 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  23.93 
 
 		 779 aa  52.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  24.41 
 
 		 839 aa  52.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  23.03 
 
 		 811 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  22.08 
 
 		 788 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  21.12 
 
 		 847 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  23.4 
 
 		 821 aa  51.6  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4813  penicillin amidase  23.15 
 
 		 790 aa  51.2  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911238  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  21.72 
 
 		 788 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  21.92 
 
 		 837 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  22.83 
 
 		 813 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  27.42 
 
 		 817 aa  50.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1108  acylase  22.98 
 
 		 813 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  30.8 
 
 		 787 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  25.12 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3361  peptidase S45 penicillin amidase  26.17 
 
 		 769 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.272902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  22.8 
 
 		 847 aa  49.7  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1223  penicillin amidase family protein  22.87 
 
 		 810 aa  49.3  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  22.98 
 
 		 813 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  25.48 
 
 		 804 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  22.33 
 
 		 795 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.61 
 
 		 796 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  25.81 
 
 		 812 aa  48.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  25.78 
 
 		 843 aa  47.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  25.34 
 
 		 822 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>