74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_A0028 on replicon NC_007483
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  38.91 
 
 		 928 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  100 
 
 		 916 aa  1907    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  50.11 
 
 		 914 aa  917    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  43.53 
 
 		 912 aa  777    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  52.25 
 
 		 871 aa  947    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  39.56 
 
 		 908 aa  610  1e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  36.93 
 
 		 926 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  36.71 
 
 		 928 aa  599  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  37.35 
 
 		 932 aa  601  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  35.54 
 
 		 926 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  38.55 
 
 		 933 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  37.3 
 
 		 929 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  39.38 
 
 		 937 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  35.64 
 
 		 918 aa  559  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  35.19 
 
 		 921 aa  552  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  37.45 
 
 		 928 aa  555  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  36.82 
 
 		 909 aa  552  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  37.17 
 
 		 919 aa  543  1e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  33.44 
 
 		 909 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  35.33 
 
 		 934 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  34.92 
 
 		 929 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  34.23 
 
 		 934 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  32.87 
 
 		 955 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  32.48 
 
 		 941 aa  432  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  34.3 
 
 		 622 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1151 aa  190  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  26.35 
 
 		 925 aa  173  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  23.46 
 
 		 978 aa  157  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1188 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1173 aa  136  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1018 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  24.31 
 
 		 918 aa  135  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1170 aa  132  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  26.05 
 
 		 973 aa  128  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1154 aa  126  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  27.59 
 
 		 621 aa  125  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  27 
 
 		 1184 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  27.39 
 
 		 1186 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  26.25 
 
 		 869 aa  82.4  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  25.3 
 
 		 536 aa  72  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  25 
 
 		 1353 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  37.78 
 
 		 97 aa  68.9  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1347 aa  62.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1342 aa  61.6  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  22.07 
 
 		 1363 aa  60.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1440 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1365 aa  60.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  22.97 
 
 		 795 aa  58.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1346 aa  57.4  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1298 aa  57.4  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  21.6 
 
 		 1282 aa  56.2  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  21.12 
 
 		 1290 aa  55.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1339 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1339 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1321 aa  54.3  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1366 aa  54.3  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  20.32 
 
 		 1409 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  23.25 
 
 		 694 aa  51.6  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  30.33 
 
 		 1055 aa  51.2  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1243 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1441 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  22.65 
 
 		 1089 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  23.21 
 
 		 504 aa  49.7  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  27.87 
 
 		 1331 aa  49.3  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  20.22 
 
 		 1452 aa  48.5  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1422 aa  48.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1333 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1373 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  30.28 
 
 		 333 aa  46.6  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1104 aa  46.2  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  28.57 
 
 		 1338 aa  45.8  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1088 aa  45.8  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  28.93 
 
 		 1322 aa  45.4  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  29.32 
 
 		 1432 aa  45.4  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>