128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4013 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  100 
 
 
207 aa  419  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  43 
 
 
207 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  37.06 
 
 
221 aa  161  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  42.79 
 
 
202 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  42.29 
 
 
274 aa  146  3e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  38.24 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  40.3 
 
 
234 aa  144  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  41.46 
 
 
235 aa  143  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  40.8 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  43.72 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  42.64 
 
 
242 aa  139  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  36.36 
 
 
205 aa  138  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  39.7 
 
 
225 aa  131  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  33.69 
 
 
189 aa  129  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  32.16 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  35.47 
 
 
382 aa  121  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  32.37 
 
 
251 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  34.05 
 
 
242 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  33.81 
 
 
252 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  29.69 
 
 
252 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  30.29 
 
 
253 aa  99  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  35.12 
 
 
257 aa  95.9  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  31.75 
 
 
246 aa  96.3  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  32.84 
 
 
254 aa  94.7  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  33.68 
 
 
253 aa  94.4  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  27.09 
 
 
246 aa  92.8  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.97 
 
 
244 aa  92  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  31.34 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  29.76 
 
 
255 aa  89.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  30.43 
 
 
256 aa  89  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  32.09 
 
 
248 aa  88.2  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  32.06 
 
 
249 aa  87.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  29.79 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  28.42 
 
 
236 aa  86.7  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  30.54 
 
 
251 aa  86.7  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  33.82 
 
 
252 aa  85.5  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  30.64 
 
 
251 aa  85.5  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  30.89 
 
 
259 aa  84  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  32.5 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  32.54 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  29.35 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  30.81 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  29.35 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  32.85 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  29.11 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  30.98 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  33.5 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  27.88 
 
 
357 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  27.55 
 
 
510 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  33.59 
 
 
510 aa  72.8  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  28.12 
 
 
509 aa  72  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  30.65 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  27.96 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  31.52 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  29.38 
 
 
503 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  31.89 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  40.43 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  30 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  27.81 
 
 
356 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  33.33 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  28.05 
 
 
3002 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  25.65 
 
 
523 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  28.78 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  28.96 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  38.04 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  28.42 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  30.3 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  33.61 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  30.81 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  24.26 
 
 
325 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  25.24 
 
 
300 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  27.59 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2541  hypothetical protein  25.24 
 
 
329 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0273286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  30.05 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  26.22 
 
 
3021 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  24.76 
 
 
325 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  26.06 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  32.56 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  25 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  24.82 
 
 
341 aa  59.7  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  37.63 
 
 
174 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.64 
 
 
391 aa  58.5  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  28.14 
 
 
284 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  27.51 
 
 
371 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  27.36 
 
 
375 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  22.67 
 
 
1514 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  26.46 
 
 
174 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  34.07 
 
 
175 aa  56.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  30.9 
 
 
219 aa  55.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.98 
 
 
174 aa  54.7  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  27.72 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  32.67 
 
 
266 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  24.85 
 
 
546 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3674  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 
860 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  26.87 
 
 
217 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  26.87 
 
 
217 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  27.17 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  27.17 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  27.17 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  27.17 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>