256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3354 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 179 aa  356  9.999999999999999e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  94.97 
 
 		 179 aa  340  5e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  71.51 
 
 		 179 aa  259  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  62.22 
 
 		 180 aa  214  5.9999999999999996e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  62.22 
 
 		 180 aa  213  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  39.67 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  34.07 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 202 aa  97.1  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  32.04 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  26.95 
 
 		 455 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  52.83 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  27.89 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  31.91 
 
 		 877 aa  55.1  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  31.4 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  31.4 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  26.81 
 
 		 865 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  33.93 
 
 		 462 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1558  putative transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  29.55 
 
 		 309 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  32.86 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  30.58 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  30.97 
 
 		 897 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  33.03 
 
 		 479 aa  52  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  30.91 
 
 		 463 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  31.53 
 
 		 688 aa  51.6  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.47 
 
 		 605 aa  51.6  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  28.95 
 
 		 143 aa  52  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  29.25 
 
 		 139 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  31.58 
 
 		 140 aa  51.2  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  27.69 
 
 		 688 aa  51.2  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  28.47 
 
 		 366 aa  51.2  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  28.47 
 
 		 366 aa  51.2  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  28.93 
 
 		 139 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  28.93 
 
 		 139 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.91 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  30.08 
 
 		 468 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  28.03 
 
 		 464 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  29.57 
 
 		 873 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  28.3 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  48.98 
 
 		 99 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  29.93 
 
 		 845 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  51.02 
 
 		 99 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.84 
 
 		 461 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.84 
 
 		 461 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  25.81 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  27.56 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 		 139 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 		 139 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  29.5 
 
 		 246 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 		 139 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  29.17 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  26.92 
 
 		 688 aa  48.9  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 230 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  30.08 
 
 		 455 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  28.97 
 
 		 143 aa  48.5  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1634  CBS  22.15 
 
 		 457 aa  48.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3959  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.78 
 
 		 855 aa  48.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  28.78 
 
 		 229 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  24.17 
 
 		 126 aa  48.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 112 aa  47.8  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  29.5 
 
 		 229 aa  47.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3498  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.17 
 
 		 143 aa  47.8  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156756  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  26.57 
 
 		 863 aa  47.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0822  diguanylate cyclase  29.73 
 
 		 287 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  27.21 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  29.81 
 
 		 457 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  28.89 
 
 		 258 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  27.43 
 
 		 863 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2553  Cysteine synthase  24.81 
 
 		 457 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.06 
 
 		 457 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  26.03 
 
 		 348 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 304 aa  46.6  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  25.42 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  29.81 
 
 		 457 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  25.78 
 
 		 462 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  25 
 
 		 464 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  27.27 
 
 		 464 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  26.83 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  25.19 
 
 		 315 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  29.41 
 
 		 333 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 256 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  31.53 
 
 		 456 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3475  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.31 
 
 		 571 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  32.73 
 
 		 280 aa  45.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  27.43 
 
 		 136 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  28.37 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  27.97 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  26.13 
 
 		 879 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 528 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  23.62 
 
 		 907 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  24.59 
 
 		 466 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>