264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1574 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  63.93 
 
 		 184 aa  240  7e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  57.92 
 
 		 184 aa  217  7.999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  43.02 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  38.12 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 179 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 180 aa  124  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  36.87 
 
 		 180 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  33.88 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  32.43 
 
 		 880 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.33 
 
 		 457 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  35.24 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  29.2 
 
 		 888 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  33.09 
 
 		 875 aa  58.2  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  33.09 
 
 		 875 aa  57.8  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2553  Cysteine synthase  29.6 
 
 		 457 aa  55.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  31.43 
 
 		 457 aa  55.5  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1634  CBS  31.43 
 
 		 457 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  25.43 
 
 		 880 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  28.85 
 
 		 769 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 		 875 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  26.44 
 
 		 845 aa  52.4  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.03 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  27.94 
 
 		 881 aa  51.2  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  29.17 
 
 		 863 aa  51.2  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  28.57 
 
 		 455 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27.27 
 
 		 888 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  26.45 
 
 		 898 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  25.56 
 
 		 463 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  29.57 
 
 		 292 aa  50.1  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  30.7 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 255 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  26.09 
 
 		 688 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  28.57 
 
 		 459 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  34.21 
 
 		 142 aa  48.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 145 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 145 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  26.36 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  48.5  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  31.62 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 97 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  31.4 
 
 		 1560 aa  48.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 97 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  28.57 
 
 		 454 aa  48.5  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 108 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004143  hypothetical protein  37.88 
 
 		 135 aa  48.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  26.54 
 
 		 909 aa  48.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  27.03 
 
 		 453 aa  48.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  31.53 
 
 		 131 aa  47.8  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  27.48 
 
 		 201 aa  47.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  27.93 
 
 		 460 aa  47.8  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  31.11 
 
 		 455 aa  47.8  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  26.87 
 
 		 468 aa  47.8  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  28.95 
 
 		 863 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  30.7 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.56 
 
 		 1665 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  27.68 
 
 		 461 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 252 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  28.68 
 
 		 320 aa  47  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2054  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388224 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  51.02 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  45.65 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  24.43 
 
 		 880 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  36.67 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.96 
 
 		 459 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  26.45 
 
 		 640 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  25.81 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  27.93 
 
 		 258 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.91 
 
 		 633 aa  45.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3013  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  32.29 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  28.7 
 
 		 688 aa  45.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  26.55 
 
 		 459 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.29 
 
 		 243 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0822  diguanylate cyclase  31.34 
 
 		 287 aa  45.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.75 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  28.77 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.55 
 
 		 459 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  29.73 
 
 		 464 aa  45.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  43.48 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 		 688 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>