79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1558 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1558  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 206 aa  396  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2632  putative signal transduction protein with CBS domains  34.47 
 
 		 197 aa  102  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0668  putative signal transduction protein with CBS domains  35.27 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1599  CBS domain containing protein  34.91 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  27.54 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  27.87 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  26.78 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  25.41 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  25.68 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  22.88 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  28.46 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.29 
 
 		 478 aa  52  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  28.46 
 
 		 845 aa  51.2  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  22.73 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  27.94 
 
 		 291 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  25.2 
 
 		 148 aa  49.7  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  28.21 
 
 		 863 aa  49.7  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1772  CBS domain containing protein  36.44 
 
 		 141 aa  49.3  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  24.03 
 
 		 313 aa  48.5  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  22.98 
 
 		 189 aa  48.1  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  24.85 
 
 		 217 aa  48.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  21.72 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  22.58 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  23.41 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  31.36 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  26.77 
 
 		 865 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  28.8 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 723 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  28.21 
 
 		 863 aa  46.6  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 291 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  32.48 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.82 
 
 		 837 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3078  CBS domain containing protein  35.64 
 
 		 149 aa  45.1  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 153 aa  45.1  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  33.96 
 
 		 465 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  32.48 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  32.48 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  21.13 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  26.67 
 
 		 688 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  32.48 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  32.48 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  26.61 
 
 		 877 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  24.78 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 		 896 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  30 
 
 		 128 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  35.85 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  24.79 
 
 		 124 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  27.12 
 
 		 688 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  19.9 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  29.31 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  32.54 
 
 		 455 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.81 
 
 		 605 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 873 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  31.09 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  30.25 
 
 		 904 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  26.36 
 
 		 155 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.4 
 
 		 140 aa  42.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  33.33 
 
 		 456 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  29.41 
 
 		 909 aa  42.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  26.51 
 
 		 348 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  33.33 
 
 		 455 aa  42  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  33.33 
 
 		 456 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1808  signal-transduction protein  31.09 
 
 		 655 aa  42  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  30.25 
 
 		 907 aa  42  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2230  putative signal transduction protein with CBS domains  29.37 
 
 		 133 aa  42  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.24818  normal  0.0199639 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.48 
 
 		 485 aa  42  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  33.88 
 
 		 166 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  25.6 
 
 		 258 aa  41.6  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  26.98 
 
 		 269 aa  41.6  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5660  hypothetical protein  33.96 
 
 		 839 aa  41.6  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.32582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>