82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1772 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1772  CBS domain containing protein  100 
 
 
141 aa  283  5e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0184  putative signal transduction protein with CBS domains  34.29 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2638  putative signal transduction protein with CBS domains  30.22 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3697  putative signal transduction protein with CBS domains  29.55 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  28.46 
 
 
865 aa  56.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  32.79 
 
 
902 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  31.75 
 
 
907 aa  55.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  29.66 
 
 
904 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  31.36 
 
 
867 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  29.31 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  26.56 
 
 
282 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  28.7 
 
 
875 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.34 
 
 
903 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  27.42 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  28.17 
 
 
210 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1558  putative transcriptional regulator, XRE family  36.44 
 
 
206 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.4 
 
 
903 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 
380 aa  48.9  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  28.06 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  26.96 
 
 
875 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  26.45 
 
 
909 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  25.4 
 
 
252 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  26.83 
 
 
279 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  30.51 
 
 
880 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  27.12 
 
 
907 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  27.12 
 
 
845 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  28.79 
 
 
769 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  22.76 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  26.89 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.56 
 
 
903 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  29.66 
 
 
888 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 
211 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  31.3 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  28.32 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  33.91 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0552  Chloride channel core  30.6 
 
 
614 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  27.12 
 
 
909 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  29.27 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  23.81 
 
 
277 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  22.96 
 
 
210 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  27.74 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  26.67 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  27.74 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  23.26 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  27.74 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  37.74 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  27.74 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  23.88 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  26.32 
 
 
214 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.1 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.59 
 
 
873 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1130  CBS domain-containing protein  22.56 
 
 
207 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  28.77 
 
 
242 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  24.82 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  24.8 
 
 
890 aa  41.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  26.45 
 
 
138 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  26.96 
 
 
139 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  24.44 
 
 
622 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  25.42 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  31.19 
 
 
180 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  24.03 
 
 
411 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  24.06 
 
 
135 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  28.93 
 
 
904 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2357  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  34.62 
 
 
435 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.889148  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.23 
 
 
612 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  25.2 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  25.42 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  25 
 
 
217 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  25.17 
 
 
399 aa  40.8  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0605  signal-transduction protein  26.45 
 
 
211 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  24.11 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  31.75 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  25.76 
 
 
873 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  27.41 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  27.73 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  26.45 
 
 
624 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  30.19 
 
 
280 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  25.42 
 
 
138 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  25.42 
 
 
138 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  22.76 
 
 
281 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  28.33 
 
 
128 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  31.21 
 
 
208 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>