156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1789 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1789  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
367 aa  733    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2409  extracellular solute-binding protein  43.01 
 
 
359 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0527078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1477  ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0040976  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1786  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3397  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  22.66 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2047  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.454223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65920  hypothetical protein  25.73 
 
 
363 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400639  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0783  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  22.56 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3160  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
345 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2819  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  25.84 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2577  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 
343 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318212  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3515  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic binding protein  26.28 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3042  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0963971  normal  0.874753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5719  hypothetical protein  26.71 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3851  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1614  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  26.3 
 
 
338 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2911  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
347 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550297  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0326  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  26.81 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506408  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2870  PotD/PotF family extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2230  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0300  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  26.81 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000303787  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3717  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1869  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 
343 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3232  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 
343 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
355 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2543  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 
359 aa  63.5  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.924442  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  20.36 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1275  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3814  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  23.37 
 
 
341 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0560124  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4687  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  23.62 
 
 
356 aa  59.7  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0106  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  27.27 
 
 
397 aa  59.7  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1935  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 
341 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092499 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1463  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  21.88 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0308  hypothetical protein  24.04 
 
 
352 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
341 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5508  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 
347 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0465771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1955  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2914  extracellular solute-binding protein  20.71 
 
 
342 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2632  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2705  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  24.15 
 
 
342 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4108  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
349 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 
348 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2365  hypothetical protein  23.97 
 
 
361 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1336  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 
342 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1219  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  22.7 
 
 
342 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3107  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  22.7 
 
 
342 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0594  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2020  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.536453  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2702  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.08 
 
 
383 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0386  periplasmic polyamine binding protein  24.48 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02720  hypothetical protein  22.7 
 
 
352 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0735461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1897  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 
355 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179851  normal  0.425748 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 
348 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2667  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  22.02 
 
 
341 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4614  extracellular solute-binding protein  21.28 
 
 
344 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.874692  normal  0.965424 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 
350 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4790  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 
344 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03855  periplasmic polyamine binding protein  24.14 
 
 
353 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3241  extracellular solute-binding protein  21.81 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.047914  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4469  twin-arginine translocation pathway signal  24.45 
 
 
367 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.355969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0446  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1715  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1248  extracellular solute-binding protein  20.87 
 
 
347 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432427  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0443  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0563  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  21.55 
 
 
344 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0412  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  22.28 
 
 
344 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0584261  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0345  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 
364 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8146  spermidine/putrescine binding protein of ABC transporter  24.72 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00458388  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  23.3 
 
 
348 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4943  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 
340 aa  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2484  extracellular solute-binding protein  22.29 
 
 
339 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295411  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0746  putative ABC transporter binding protein subunit  21.92 
 
 
344 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
348 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6575  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 
351 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0748  putative ABC transporter binding protein subunit  21.76 
 
 
348 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07870  putative binding protein component of ABC transporter  20.47 
 
 
348 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1733  putative lipoprotein signal peptide  23.59 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0848422  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6089  ABC transporter substrate binding protein (polyamine)  22.03 
 
 
336 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5047  extracellular solute-binding protein  20.49 
 
 
338 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1643  extracellular solute-binding protein  20.33 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5469  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27299  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0643  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  22.3 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1299  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.11 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4296  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.07 
 
 
345 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458319  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1962  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.11 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4697  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4605  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2146  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.11 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543395 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1322  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.11 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0110419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1337  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.1 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0644011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1519  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6156  extracellular solute-binding protein family 1  21.08 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 
345 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0104  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  34.25 
 
 
379 aa  47.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>