More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1352 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  46.96 
 
 		 910 aa  801    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  51.35 
 
 		 922 aa  905    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  87 
 
 		 924 aa  1625    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1352  helicase-like  100 
 
 		 928 aa  1893    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  50.97 
 
 		 915 aa  880    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  38.76 
 
 		 889 aa  589  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  31.82 
 
 		 1065 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  31.82 
 
 		 1065 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  25.37 
 
 		 1037 aa  120  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  33.33 
 
 		 1187 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  22.16 
 
 		 1051 aa  106  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  25.07 
 
 		 1046 aa  106  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  22.12 
 
 		 1052 aa  99.4  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  27.67 
 
 		 971 aa  97.8  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  32.37 
 
 		 584 aa  97.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  32.37 
 
 		 584 aa  95.9  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  26.86 
 
 		 572 aa  93.2  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  30.22 
 
 		 919 aa  91.7  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  27.92 
 
 		 962 aa  91.3  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 948 aa  90.9  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  35.83 
 
 		 972 aa  88.6  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  32.24 
 
 		 467 aa  88.2  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.13 
 
 		 1212 aa  87.8  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  28.81 
 
 		 966 aa  87.4  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  27.1 
 
 		 969 aa  87  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  35.6 
 
 		 1165 aa  85.5  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  27.25 
 
 		 1169 aa  85.1  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  38.41 
 
 		 829 aa  85.1  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  36.81 
 
 		 1044 aa  84.7  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  27.3 
 
 		 933 aa  84.7  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  34.64 
 
 		 1160 aa  84.7  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  25.86 
 
 		 1169 aa  84.3  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  29.25 
 
 		 906 aa  84.7  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  36.8 
 
 		 1147 aa  84.3  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  25 
 
 		 988 aa  84  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  30.53 
 
 		 949 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  32.24 
 
 		 760 aa  84  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  38.24 
 
 		 1201 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  38.24 
 
 		 1201 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  32.89 
 
 		 1168 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  37.91 
 
 		 1170 aa  83.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  26.76 
 
 		 969 aa  83.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  34.44 
 
 		 1170 aa  83.2  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  27.97 
 
 		 1172 aa  83.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  35.76 
 
 		 968 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  36.77 
 
 		 1145 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  30.77 
 
 		 1095 aa  82.4  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  36.42 
 
 		 1136 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  30.23 
 
 		 951 aa  82.8  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  27.11 
 
 		 921 aa  82.4  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  24.29 
 
 		 967 aa  82.4  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  33.54 
 
 		 1058 aa  81.6  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  44.44 
 
 		 949 aa  81.6  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 560 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  31.33 
 
 		 1069 aa  81.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  22.19 
 
 		 1080 aa  81.3  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  31.33 
 
 		 1069 aa  81.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  27.5 
 
 		 941 aa  80.5  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  27.5 
 
 		 941 aa  80.5  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.56 
 
 		 877 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  34.81 
 
 		 940 aa  79.7  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  34.93 
 
 		 1137 aa  79.7  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  27.62 
 
 		 915 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  28.49 
 
 		 560 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  27.62 
 
 		 916 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  33.54 
 
 		 1043 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  27.96 
 
 		 560 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  27.96 
 
 		 560 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  27.96 
 
 		 560 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  27.96 
 
 		 560 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  27.96 
 
 		 560 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  34.44 
 
 		 1170 aa  79.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  32.89 
 
 		 1013 aa  79.3  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  27.96 
 
 		 560 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  27.96 
 
 		 560 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  27.27 
 
 		 915 aa  79  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  27.96 
 
 		 560 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  36.97 
 
 		 1057 aa  79  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.74 
 
 		 1028 aa  78.6  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  32.61 
 
 		 1049 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  42.22 
 
 		 955 aa  78.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  29.52 
 
 		 963 aa  78.6  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  27.33 
 
 		 706 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  37.62 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  42.59 
 
 		 1194 aa  78.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  30.95 
 
 		 805 aa  78.2  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  34.48 
 
 		 1170 aa  78.2  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  29.31 
 
 		 724 aa  77.8  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  37.12 
 
 		 929 aa  77  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.68 
 
 		 961 aa  77.4  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  27.69 
 
 		 1077 aa  77.4  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  24.25 
 
 		 942 aa  77.4  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  36.13 
 
 		 560 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.49 
 
 		 894 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  33.1 
 
 		 801 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  31.2 
 
 		 1082 aa  77  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  40 
 
 		 1116 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  31.21 
 
 		 986 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  29.3 
 
 		 774 aa  76.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  27.78 
 
 		 961 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>