More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0993 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00413  multidrug efflux system protein  41.05 
 
 		 1049 aa  753    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02361  aminoglycoside/multidrug efflux system  40.08 
 
 		 1037 aa  761    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03124  multidrug efflux system protein  40.92 
 
 		 1034 aa  752    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0440  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.82 
 
 		 1034 aa  750    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.08 
 
 		 1037 aa  761    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3148  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.05 
 
 		 1049 aa  753    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3426  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.91 
 
 		 1059 aa  769    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3456  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.69 
 
 		 1042 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.417579 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.91 
 
 		 1054 aa  792    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1597  multidrug efflux transporter MexF  43.14 
 
 		 1055 aa  813    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586106  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0010  putative acriflavin resistance transmembrane protein  41.49 
 
 		 1049 aa  778    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.461171  normal  0.0539399 
 
 
-
 
NC_003296  RS01889  drug efflux transmembrane protein  41.51 
 
 		 1053 aa  769    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1355  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  44.79 
 
 		 1052 aa  874    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1537  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  46.47 
 
 		 1037 aa  917    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0415  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  41.51 
 
 		 1040 aa  828    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0292  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  43.7 
 
 		 1051 aa  853    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0334  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  57.4 
 
 		 1074 aa  1165    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3100  multidrug efflux RND transporter MexF  41.99 
 
 		 1063 aa  766    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0635013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4304  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.72 
 
 		 1044 aa  739    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1465  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  41.87 
 
 		 1061 aa  768    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372368  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2580  hypothetical protein  40.49 
 
 		 1050 aa  764    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2434  hypothetical protein  40.4 
 
 		 1050 aa  760    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2282  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.61 
 
 		 1047 aa  740    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0161777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2865  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.69 
 
 		 1048 aa  773    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536014  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2968  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.38 
 
 		 1063 aa  778    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.599397  normal  0.253976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4008  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.76 
 
 		 1044 aa  737    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507214  normal  0.0226563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.28 
 
 		 1040 aa  810    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3062  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.55 
 
 		 1057 aa  815    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3441  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.21 
 
 		 1051 aa  778    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.388058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4089  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.7 
 
 		 1050 aa  738    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.31 
 
 		 1057 aa  806    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1019  inner membrane protein  40.43 
 
 		 1066 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1841  multidrug-efflux transporter protein  41.87 
 
 		 1061 aa  768    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1130  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.72 
 
 		 1059 aa  907    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2658  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.78 
 
 		 1063 aa  788    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2757  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.12 
 
 		 1043 aa  749    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2894  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.52 
 
 		 1032 aa  772    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0114017  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3318  cation efflux transporter  41.71 
 
 		 1039 aa  744    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1100  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  40.65 
 
 		 1060 aa  748    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3095  cation/multidrug efflux pump  43.02 
 
 		 1042 aa  844    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00680948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0296  hydrophobe/amphiphile efflux pump, HAE1  42.05 
 
 		 1066 aa  771    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1005  hydrophobe/amphiphile efflux pump protein  43.13 
 
 		 1057 aa  746    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1664  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.21 
 
 		 1044 aa  765    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186908  normal  0.57083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0401  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.46 
 
 		 1055 aa  948    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.913827  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0536  resistance-nodulation-cell division family transporter  39.42 
 
 		 1034 aa  775    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0043  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.45 
 
 		 1042 aa  741    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0688  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.81 
 
 		 1057 aa  821    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0691  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.93 
 
 		 1038 aa  794    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.553697  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0886  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.45 
 
 		 1052 aa  748    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1118  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.95 
 
 		 1052 aa  741    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.558549  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2105  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  42.05 
 
 		 1061 aa  767    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.179451  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0681  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  40.53 
 
 		 1066 aa  740    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2567  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.65 
 
 		 1047 aa  754    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.461697 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1190  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  72.24 
 
 		 1057 aa  1459    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0696515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3585  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  68.85 
 
 		 1050 aa  1494    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.91 
 
 		 1047 aa  847    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.518068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1592  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.36 
 
 		 1037 aa  816    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0951856  unclonable  0.000000469931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2036  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.4 
 
 		 1059 aa  750    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.602316  hitchhiker  0.00575958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0709  RND efflux hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  41.55 
 
 		 1069 aa  775    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2892  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  40.94 
 
 		 1088 aa  742    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1230  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  42.64 
 
 		 1076 aa  816    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2310  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.58 
 
 		 1062 aa  792    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0949  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.77 
 
 		 1066 aa  814    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0712  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.84 
 
 		 1057 aa  785    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0993  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  100 
 
 		 1048 aa  2085    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1702  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.83 
 
 		 1063 aa  809    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.710777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3589  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.82 
 
 		 1050 aa  775    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1068  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.74 
 
 		 1059 aa  749    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.186507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2817  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.81 
 
 		 1043 aa  744    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4071  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.95 
 
 		 1055 aa  791    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  0.202748 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3420  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  51.2 
 
 		 1042 aa  1020    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1998  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.81 
 
 		 1066 aa  738    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3015  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.95 
 
 		 1061 aa  773    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0738  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.51 
 
 		 1055 aa  759    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0941  acriflavin resistance protein D  39.6 
 
 		 1056 aa  747    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1408  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.97 
 
 		 1058 aa  776    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.902436  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4698  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.05 
 
 		 1071 aa  772    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.294616  normal  0.444302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05540  RND multidrug efflux transporter MexB  40.58 
 
 		 1046 aa  741    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.277681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32390  RND multidrug efflux transporter MexF  42.78 
 
 		 1062 aa  771    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60830  multidrug efflux RND transporter MexD  41.59 
 
 		 1043 aa  739    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.81 
 
 		 1066 aa  738    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5351  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.95 
 
 		 1061 aa  773    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31153  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1076  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.43 
 
 		 1063 aa  748    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.421657  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1457  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.26 
 
 		 1055 aa  825    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000798188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3922  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.25 
 
 		 1052 aa  853    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.52 
 
 		 1041 aa  743    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.362215  unclonable  0.00000213823 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0118  transmembrane efflux protein  40.1 
 
 		 1048 aa  788    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0330  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.32 
 
 		 1054 aa  767    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0411  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.5 
 
 		 1073 aa  774    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0776  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.34 
 
 		 1055 aa  761    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2942  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.86 
 
 		 1041 aa  741    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2139  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.66 
 
 		 1038 aa  883    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3455  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.5 
 
 		 1036 aa  819    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0141  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.28 
 
 		 1047 aa  816    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2900  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.53 
 
 		 1046 aa  886    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0388  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.39 
 
 		 1052 aa  739    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1363  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.82 
 
 		 1081 aa  810    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.01573  normal  0.0165317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1299  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.79 
 
 		 1081 aa  764    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2886  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.52 
 
 		 1057 aa  751    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315153  normal  0.171354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2255  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.21 
 
 		 1054 aa  765    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>