108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0943 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  44.07 
 
 		 2334 aa  1238    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  100 
 
 		 2328 aa  4543    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.63 
 
 		 2387 aa  1167    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  41.98 
 
 		 1058 aa  489  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  71.39 
 
 		 607 aa  472  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.61 
 
 		 1081 aa  458  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.11 
 
 		 4500 aa  365  6e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  35.71 
 
 		 1419 aa  347  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  47.35 
 
 		 770 aa  340  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.84 
 
 		 800 aa  333  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  34.47 
 
 		 991 aa  310  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.68 
 
 		 1004 aa  308  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  47.24 
 
 		 2079 aa  307  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.54 
 
 		 1148 aa  296  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  47.44 
 
 		 390 aa  292  7e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  35.5 
 
 		 1009 aa  285  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.27 
 
 		 1137 aa  284  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  45.53 
 
 		 1169 aa  281  1e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  36.22 
 
 		 1003 aa  280  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.4 
 
 		 985 aa  273  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  36.27 
 
 		 1018 aa  265  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  51.41 
 
 		 2716 aa  263  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  45 
 
 		 1417 aa  258  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  49.83 
 
 		 1105 aa  258  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  45.54 
 
 		 1447 aa  249  4.9999999999999997e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  44.92 
 
 		 1451 aa  243  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  48.93 
 
 		 5613 aa  243  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.16 
 
 		 3589 aa  241  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.98 
 
 		 4016 aa  231  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  45.92 
 
 		 1371 aa  213  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  48.06 
 
 		 2217 aa  206  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  40.24 
 
 		 1994 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  40.54 
 
 		 2271 aa  201  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.31 
 
 		 3132 aa  196  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  42.16 
 
 		 1999 aa  192  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.27 
 
 		 1637 aa  181  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.68 
 
 		 2054 aa  181  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  31.71 
 
 		 1013 aa  181  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.74 
 
 		 2887 aa  180  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  38.68 
 
 		 1910 aa  179  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.93 
 
 		 481 aa  172  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.76 
 
 		 2834 aa  171  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.57 
 
 		 4855 aa  166  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.19 
 
 		 1844 aa  164  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  43.7 
 
 		 1691 aa  164  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.4 
 
 		 759 aa  163  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.34 
 
 		 808 aa  154  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.89 
 
 		 956 aa  149  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  27.08 
 
 		 715 aa  134  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  31.62 
 
 		 2679 aa  126  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.29 
 
 		 2744 aa  119  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  29.39 
 
 		 3349 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  31.68 
 
 		 1741 aa  114  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  37.22 
 
 		 3299 aa  111  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  35.68 
 
 		 4009 aa  109  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  34.17 
 
 		 4135 aa  107  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.2 
 
 		 3340 aa  103  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  37.79 
 
 		 4007 aa  98.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  32.97 
 
 		 3332 aa  98.6  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  38.34 
 
 		 4132 aa  98.2  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  38.37 
 
 		 4347 aa  96.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  39.57 
 
 		 4435 aa  94  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  34.96 
 
 		 4177 aa  93.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1009  hypothetical protein  50.47 
 
 		 122 aa  92.8  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  35.78 
 
 		 3409 aa  90.9  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  34.88 
 
 		 4030 aa  89.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  37.37 
 
 		 3472 aa  89.4  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  36.63 
 
 		 4049 aa  89.4  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  36.67 
 
 		 4184 aa  88.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.39 
 
 		 946 aa  82.8  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  33.33 
 
 		 4170 aa  82.8  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.94 
 
 		 4219 aa  81.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  35.56 
 
 		 2296 aa  78.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  36.44 
 
 		 1937 aa  76.3  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  35.37 
 
 		 4283 aa  75.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  31.71 
 
 		 1467 aa  75.5  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  25.83 
 
 		 2637 aa  69.7  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.58 
 
 		 1772 aa  63.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  27.51 
 
 		 3333 aa  61.6  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4098  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1064 aa  60.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.1 
 
 		 1650 aa  57.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0006  filamentous haemagglutinin-like protein  36.67 
 
 		 845 aa  55.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.81 
 
 		 3299 aa  55.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1755  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  25 
 
 		 965 aa  55.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  32.96 
 
 		 1672 aa  53.5  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.66 
 
 		 3535 aa  53.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3762  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.33 
 
 		 5342 aa  53.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.61 
 
 		 3419 aa  53.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1530  conserved hypothetical protein, hemagglutination domain protein  43.33 
 
 		 1085 aa  52.8  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.307259  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2349  filamentous haemagglutinin-like protein  34.55 
 
 		 804 aa  52  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3737  filamentous haemagglutinin-like protein  40 
 
 		 805 aa  52  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  31.97 
 
 		 1855 aa  52.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.05 
 
 		 1570 aa  51.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2359  hypothetical protein  46.43 
 
 		 212 aa  51.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486627  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0529  putative periplasmic protein  28.99 
 
 		 553 aa  51.2  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.935894  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1743  putative periplasmic protein  28.99 
 
 		 553 aa  51.2  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0837  hemagglutination domain-containing protein  38.68 
 
 		 139 aa  50.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0185805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  40 
 
 		 1672 aa  49.7  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0651  hypothetical protein  28.12 
 
 		 3954 aa  49.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2674  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  30.88 
 
 		 952 aa  48.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>