108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0725 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  100 
 
 		 2334 aa  4549    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  44.14 
 
 		 2328 aa  1263    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.45 
 
 		 2387 aa  1285    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  43.73 
 
 		 1058 aa  496  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  60.45 
 
 		 607 aa  464  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.26 
 
 		 1081 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  50.37 
 
 		 4500 aa  354  8.999999999999999e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  36.67 
 
 		 1419 aa  352  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  46.12 
 
 		 770 aa  335  4e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  35.27 
 
 		 991 aa  333  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.45 
 
 		 800 aa  329  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.87 
 
 		 1004 aa  322  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 		 1148 aa  322  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  48.09 
 
 		 2079 aa  315  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.95 
 
 		 985 aa  310  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  35.25 
 
 		 1003 aa  307  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.69 
 
 		 1137 aa  302  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  47.01 
 
 		 390 aa  296  4e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  33.01 
 
 		 1009 aa  295  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  44.89 
 
 		 1169 aa  286  4.0000000000000003e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  34.75 
 
 		 1018 aa  266  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  51.41 
 
 		 2716 aa  265  6.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  50.5 
 
 		 1105 aa  259  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  46.36 
 
 		 1417 aa  259  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  49.66 
 
 		 1447 aa  251  9e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.77 
 
 		 5613 aa  248  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  48.97 
 
 		 1451 aa  246  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.91 
 
 		 3589 aa  229  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.47 
 
 		 4016 aa  226  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.69 
 
 		 2744 aa  219  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  46.36 
 
 		 1371 aa  216  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.23 
 
 		 2217 aa  213  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  32.18 
 
 		 1013 aa  201  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.84 
 
 		 3132 aa  200  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  41.58 
 
 		 1999 aa  196  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  38.82 
 
 		 1994 aa  195  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  41.72 
 
 		 2271 aa  195  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.4 
 
 		 2887 aa  186  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.36 
 
 		 1637 aa  182  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.33 
 
 		 2054 aa  179  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  38.33 
 
 		 1910 aa  178  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.29 
 
 		 481 aa  171  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.33 
 
 		 808 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  46.41 
 
 		 1691 aa  166  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.63 
 
 		 759 aa  164  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.7 
 
 		 1844 aa  163  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.13 
 
 		 2834 aa  159  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.78 
 
 		 956 aa  150  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  29.76 
 
 		 2679 aa  129  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40 
 
 		 4855 aa  121  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  35.86 
 
 		 3299 aa  118  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  28.69 
 
 		 3349 aa  118  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  33.02 
 
 		 1741 aa  116  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  35.74 
 
 		 4009 aa  114  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  34.58 
 
 		 4135 aa  111  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  38.58 
 
 		 715 aa  108  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  39.89 
 
 		 4007 aa  106  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  39.31 
 
 		 4132 aa  103  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.98 
 
 		 3340 aa  102  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  38.64 
 
 		 4347 aa  100  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  34.78 
 
 		 4177 aa  97.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  36.61 
 
 		 4030 aa  96.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  32.28 
 
 		 3332 aa  95.1  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  39.04 
 
 		 4435 aa  94.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1009  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  94.4  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  37.79 
 
 		 4049 aa  93.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  36.21 
 
 		 4184 aa  91.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  39.46 
 
 		 3472 aa  88.6  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  33.33 
 
 		 4170 aa  86.7  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  34.56 
 
 		 3409 aa  86.7  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.42 
 
 		 946 aa  85.5  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  37.5 
 
 		 1672 aa  80.9  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.57 
 
 		 4219 aa  80.5  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  36.05 
 
 		 4283 aa  76.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  35.25 
 
 		 1467 aa  72.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  34.65 
 
 		 1937 aa  70.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  24.07 
 
 		 2637 aa  62.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.76 
 
 		 1772 aa  62  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  33.91 
 
 		 1672 aa  58.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2359  hypothetical protein  46.67 
 
 		 212 aa  57  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  40.59 
 
 		 2296 aa  57.4  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  30.04 
 
 		 3333 aa  57  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2349  filamentous haemagglutinin-like protein  37.5 
 
 		 804 aa  56.2  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0006  filamentous haemagglutinin-like protein  29.32 
 
 		 845 aa  55.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1755  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.32 
 
 		 965 aa  55.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655087 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0529  putative periplasmic protein  34.21 
 
 		 553 aa  54.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.935894  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1743  putative periplasmic protein  34.21 
 
 		 553 aa  54.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0837  hemagglutination domain-containing protein  31.54 
 
 		 139 aa  53.9  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0185805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  27.95 
 
 		 1855 aa  54.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.56 
 
 		 1650 aa  53.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3373  GLUG domain protein  30.14 
 
 		 578 aa  52.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3762  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.03 
 
 		 5342 aa  52  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1759  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  43.28 
 
 		 758 aa  52  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2353  filamentous haemagglutinin-like protein  35.71 
 
 		 824 aa  51.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0651  hypothetical protein  27.71 
 
 		 3954 aa  51.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4098  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1064 aa  49.7  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2530  filamentous haemagglutinin-like protein  27.93 
 
 		 776 aa  49.3  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.957928 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1530  conserved hypothetical protein, hemagglutination domain protein  31.82 
 
 		 1085 aa  49.3  0.0009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.307259  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1390  filamentous haemagglutinin-like protein  38.36 
 
 		 1033 aa  47.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.379495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2352  filamentous haemagglutinin-like protein  36.84 
 
 		 820 aa  48.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>