More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2782 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  100 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  74.49 
 
 
252 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  71.61 
 
 
256 aa  344  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  69.49 
 
 
247 aa  334  7.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  67.66 
 
 
256 aa  321  9.000000000000001e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  66.53 
 
 
280 aa  318  7e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  67.25 
 
 
255 aa  315  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  66.39 
 
 
250 aa  315  5e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  66.67 
 
 
255 aa  315  6e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  64.46 
 
 
277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  70.8 
 
 
257 aa  308  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  61.6 
 
 
262 aa  305  6e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  63.75 
 
 
258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  64.73 
 
 
268 aa  300  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  66.23 
 
 
258 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  63.04 
 
 
271 aa  298  6e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  64.5 
 
 
455 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  61.16 
 
 
258 aa  296  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  64.41 
 
 
253 aa  295  5e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  63.56 
 
 
288 aa  295  6e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  62.25 
 
 
258 aa  294  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  59.84 
 
 
255 aa  294  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  61.76 
 
 
266 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.73 
 
 
274 aa  293  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  59.11 
 
 
263 aa  291  6e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  58.68 
 
 
291 aa  291  6e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  61.97 
 
 
264 aa  290  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  63.29 
 
 
312 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.56 
 
 
264 aa  288  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  64.32 
 
 
445 aa  286  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  60.67 
 
 
277 aa  285  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  55.34 
 
 
279 aa  282  3.0000000000000004e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  59.32 
 
 
259 aa  279  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  60.87 
 
 
253 aa  279  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  61.18 
 
 
247 aa  277  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  64.15 
 
 
250 aa  277  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  58.44 
 
 
293 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.13 
 
 
245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  63.87 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  58.68 
 
 
255 aa  271  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  61.25 
 
 
255 aa  271  8.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  58.85 
 
 
302 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  59.21 
 
 
279 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  62.74 
 
 
244 aa  263  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  57.39 
 
 
256 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  58.8 
 
 
257 aa  261  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  53.72 
 
 
252 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  56.03 
 
 
261 aa  258  6e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  54.39 
 
 
269 aa  258  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  56.2 
 
 
245 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  54.78 
 
 
243 aa  254  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  53.69 
 
 
266 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  51.21 
 
 
253 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  54.51 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  55.51 
 
 
277 aa  240  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  49.33 
 
 
228 aa  239  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  55.93 
 
 
241 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  52.16 
 
 
244 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  54.19 
 
 
239 aa  237  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  58.26 
 
 
249 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  54.95 
 
 
272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
279 aa  230  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
248 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  49.31 
 
 
227 aa  228  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  56.79 
 
 
249 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  51.74 
 
 
255 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  54.11 
 
 
248 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.73 
 
 
230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
271 aa  225  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  56.72 
 
 
224 aa  224  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  53 
 
 
243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  47.49 
 
 
229 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 
319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  47.84 
 
 
240 aa  216  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.04 
 
 
240 aa  215  4e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  52.38 
 
 
247 aa  215  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  47.5 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  44.5 
 
 
226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  47.87 
 
 
225 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  48.16 
 
 
253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  44.34 
 
 
229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
221 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  50.44 
 
 
238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  48.5 
 
 
233 aa  211  7e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  47.03 
 
 
232 aa  211  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  48.18 
 
 
222 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4777  ABC transporter related  47.11 
 
 
262 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  48.46 
 
 
240 aa  210  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  45.16 
 
 
227 aa  209  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  47.89 
 
 
225 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4665  ABC transporter, ATP binding protein  48.88 
 
 
262 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 
245 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  45.29 
 
 
229 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.83 
 
 
239 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  51.33 
 
 
247 aa  208  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  47.98 
 
 
245 aa  208  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.69 
 
 
230 aa  208  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  50.22 
 
 
248 aa  208  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  48.21 
 
 
251 aa  208  9e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>