More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2775 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2775  beta-lactamase  100 
 
 		 472 aa  907    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.987091 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  30 
 
 		 481 aa  183  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  30 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  30 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  29.46 
 
 		 483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  30.21 
 
 		 490 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  29.73 
 
 		 463 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  29.46 
 
 		 481 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  27.6 
 
 		 483 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  28.22 
 
 		 483 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  37.54 
 
 		 560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  36.49 
 
 		 497 aa  143  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.08 
 
 		 480 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.77 
 
 		 514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  33.81 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  32.47 
 
 		 635 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  34.74 
 
 		 525 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  29.19 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  28.65 
 
 		 566 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  27.46 
 
 		 477 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  29.46 
 
 		 513 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  29.43 
 
 		 367 aa  100  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  25 
 
 		 1032 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  33.49 
 
 		 507 aa  97.8  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  22.16 
 
 		 498 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  22.16 
 
 		 498 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.15 
 
 		 508 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  27.89 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  25.64 
 
 		 353 aa  95.9  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3756  beta-lactamase  30.58 
 
 		 378 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  27.6 
 
 		 455 aa  94.4  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  33.75 
 
 		 463 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  33.24 
 
 		 476 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  29.33 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  29.97 
 
 		 523 aa  91.3  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  22.63 
 
 		 482 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  27.94 
 
 		 513 aa  90.5  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  28.57 
 
 		 526 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  22.41 
 
 		 482 aa  90.1  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  30.24 
 
 		 455 aa  90.1  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  29.13 
 
 		 588 aa  90.1  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  27.25 
 
 		 362 aa  89.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  30.84 
 
 		 517 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  29.94 
 
 		 530 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.64 
 
 		 505 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  30.03 
 
 		 437 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.94 
 
 		 487 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.09 
 
 		 399 aa  87  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  29.62 
 
 		 533 aa  87  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  25.83 
 
 		 475 aa  86.7  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.78 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  28.49 
 
 		 480 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.25 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  27.45 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  27.67 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  30.4 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  28.15 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  27.41 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  31.03 
 
 		 610 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  25.57 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  26.69 
 
 		 513 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03210  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.1 
 
 		 521 aa  83.6  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.92 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  24.18 
 
 		 1055 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  27.84 
 
 		 519 aa  82.8  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  27.41 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  23.25 
 
 		 342 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.52 
 
 		 388 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.4 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  26.69 
 
 		 603 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  24 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  29.34 
 
 		 529 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  27.14 
 
 		 620 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  27.06 
 
 		 513 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  25.43 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.81 
 
 		 595 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  30.17 
 
 		 674 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  29.7 
 
 		 601 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  25.8 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  31.97 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.16 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  23.67 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  24.19 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.41 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  27.41 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.63 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  28.38 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.93 
 
 		 681 aa  80.1  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  27.49 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  29.59 
 
 		 567 aa  80.1  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  28.47 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  33.55 
 
 		 409 aa  79.7  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.35 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  27.57 
 
 		 524 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  25.36 
 
 		 386 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  32.29 
 
 		 593 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  28.2 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  23.58 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  23.96 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.67 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>