More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2194 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2194  integrase family protein  100 
 
 		 329 aa  648    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000240835  hitchhiker  0.000237132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3447  integrase family protein  58.2 
 
 		 324 aa  332  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2334  phage integrase family protein  59.94 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113164 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3189  integrase family protein  57.55 
 
 		 345 aa  326  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000247196  hitchhiker  0.000000000920932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4455  integrase family protein  59.19 
 
 		 339 aa  325  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000000349863  hitchhiker  0.00111504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2477  integrase family protein  59.57 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380932  normal  0.877994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  29.54 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  29.49 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  31.27 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  32.88 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.76 
 
 		 299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  27.06 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  26.38 
 
 		 296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.99 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  28.83 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  27.45 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  31.4 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  27.15 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  28.47 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  31.34 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  32.38 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.21 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  31.23 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  36.13 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  31.88 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  27.86 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  33.94 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  29.9 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.78 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  30.74 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  31.18 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  31.97 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  34.46 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  30.77 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  24.25 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  29.93 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  29.93 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  29.37 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  27.93 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  28.12 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  34.03 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  29.39 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  30.32 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  29.39 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  29.18 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  32.53 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  30.16 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  28.98 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  25.57 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  25.52 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  28.67 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  32.9 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  29.51 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  27.88 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  30.23 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  31.4 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  26.8 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2383  integrase family protein  30.82 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000443336  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  29.93 
 
 		 310 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  27.78 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  26.25 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.78 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  26.5 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.66 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  29.51 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.86 
 
 		 322 aa  102  8e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.31 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  33.23 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.96 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  32.01 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.74 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  25.83 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  32.99 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  25.83 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.74 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  30.25 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  25.94 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  29.7 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  26.67 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.3 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.87 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  28.43 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.87 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.03 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  31.19 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.08 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.08 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.03 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  23.92 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.03 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.82 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.85 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.08 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  29.64 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.08 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  29.32 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  31.13 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.64 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>