More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2948 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  59.67 
 
 		 195 aa  208  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1434  transcriptional regulator, XRE family  55.21 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.887851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1418  transcriptional regulator, XRE family  50.51 
 
 		 203 aa  171  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.560909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  45.51 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 191 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  42.61 
 
 		 187 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  38.8 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0599  transcriptional regulator, XRE family  48.88 
 
 		 193 aa  118  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  40.11 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04340  predicted transcriptional regulator  37.97 
 
 		 189 aa  102  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 199 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 179 aa  91.7  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 204 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  32.42 
 
 		 187 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  32.42 
 
 		 187 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  33.52 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  29.26 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  32.12 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 269 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  32.58 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  28.34 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  30.73 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  31.66 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1934  DNA-binding protein  29.28 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  31.84 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  29.28 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  27.47 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  27.47 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  27.47 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  29.63 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  29.63 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  29.63 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  29.63 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  29.63 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  29.63 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  29.63 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 182 aa  72  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  31.61 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 229 aa  72  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  29.63 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  26.97 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  28.49 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  29.01 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>