More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1666 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1666  ABC transporter related  100 
 
 		 374 aa  716    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022862  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  57.68 
 
 		 364 aa  333  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  57.27 
 
 		 364 aa  317  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  45.38 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  50.87 
 
 		 349 aa  279  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  45.5 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  49.11 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  46.51 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  49.56 
 
 		 342 aa  275  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  52.65 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  46.36 
 
 		 346 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  49.28 
 
 		 352 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  44.54 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  43.1 
 
 		 356 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  45.53 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  42.9 
 
 		 346 aa  263  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  47.77 
 
 		 350 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  46.36 
 
 		 349 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  46.36 
 
 		 349 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  46.36 
 
 		 349 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  45.77 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  49.71 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  43.42 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  45.53 
 
 		 352 aa  255  8e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  43.92 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  47.7 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  43.15 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  43.15 
 
 		 349 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  43.27 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 349 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  43.73 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7419  ABC transporter related  50.5 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  44.67 
 
 		 353 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2072  ABC transporter related protein  51.58 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  43.73 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  46.88 
 
 		 357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  40.72 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  43.5 
 
 		 344 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2020  ABC transporter related  48.72 
 
 		 353 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  39.46 
 
 		 360 aa  236  7e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  39.13 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  39.42 
 
 		 369 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  44.12 
 
 		 363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  41.76 
 
 		 369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.64 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  44.58 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  44.61 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.3 
 
 		 353 aa  230  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  49.64 
 
 		 345 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 		 353 aa  229  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  42.26 
 
 		 373 aa  229  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  39.29 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  43.79 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  38.62 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  40.64 
 
 		 361 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  47.16 
 
 		 345 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  45.61 
 
 		 365 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  40.63 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  38.64 
 
 		 357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  42.77 
 
 		 378 aa  225  8e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  40.59 
 
 		 355 aa  225  9e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  44.44 
 
 		 373 aa  225  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  39.7 
 
 		 347 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  45.58 
 
 		 387 aa  224  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  41.33 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  43.35 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.38 
 
 		 349 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.17 
 
 		 370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.46 
 
 		 356 aa  222  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  43.84 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  40.41 
 
 		 353 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.96 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0666  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.12 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0172946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  40.18 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  39.94 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.94 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  40.12 
 
 		 353 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  41.23 
 
 		 373 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  38.1 
 
 		 378 aa  219  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  40.34 
 
 		 366 aa  219  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  40.48 
 
 		 357 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.17 
 
 		 352 aa  219  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  38.42 
 
 		 362 aa  219  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.41 
 
 		 377 aa  219  8.999999999999998e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  38.24 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  40.46 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.18 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  42.47 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  41.23 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  44.41 
 
 		 334 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  40.23 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  38.42 
 
 		 358 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  45.35 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  42.47 
 
 		 346 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.82 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.82 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.82 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.52 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>