More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5360 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  66.13 
 
 		 502 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  91.42 
 
 		 501 aa  907    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  65.93 
 
 		 504 aa  641    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  73.9 
 
 		 507 aa  751    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  69.74 
 
 		 500 aa  689    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  68.28 
 
 		 503 aa  688    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  64.71 
 
 		 495 aa  636    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  87.37 
 
 		 512 aa  897    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  87.58 
 
 		 512 aa  900    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  64.11 
 
 		 504 aa  651    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  67 
 
 		 510 aa  661    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 		 502 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  81.98 
 
 		 505 aa  815    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  87.58 
 
 		 512 aa  900    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 509 aa  1033    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  63.13 
 
 		 502 aa  629  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  64.09 
 
 		 515 aa  627  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 528 aa  614  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  61.18 
 
 		 501 aa  613  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  63.91 
 
 		 503 aa  613  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  58.94 
 
 		 565 aa  588  1e-167  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  60.37 
 
 		 496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  57.98 
 
 		 560 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 500 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 499 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 		 516 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 506 aa  542  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 		 499 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 		 500 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  58.13 
 
 		 499 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 512 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 510 aa  524  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 501 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 		 504 aa  504  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 520 aa  500  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 1113 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 1094 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  50.81 
 
 		 1098 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 1100 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 1111 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 1112 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 1112 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 1101 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 1100 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 1138 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 1120 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.07 
 
 		 1147 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 491 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 1172 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 573 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 573 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 583 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 510 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 499 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 573 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 497 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 488 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 501 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.45 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 494 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 647 aa  382  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 532 aa  379  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 491 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 561 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 494 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 511 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 515 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 493 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 1118 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 506 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 578 aa  368  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 524 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 508 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 499 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 577 aa  365  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 502 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 496 aa  368  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 499 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 510 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 499 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 516 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 515 aa  364  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 508 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>