More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0953 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0733  acyl-CoA synthetase  95.3 
 
 		 532 aa  996    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.747882  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10561  acyl-CoA synthetase  83.71 
 
 		 571 aa  909    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0256349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0953  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 532 aa  1084    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0739  acyl-CoA synthetase  95.11 
 
 		 532 aa  994    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3976  AMP-dependent synthetase and ligase  73.08 
 
 		 546 aa  801    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2729  acyl-CoA synthetase  72.59 
 
 		 559 aa  815    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0015  acyl-CoA synthetase  93.23 
 
 		 547 aa  970    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0753  acyl-CoA synthetase  95.11 
 
 		 532 aa  994    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.627426  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  51.35 
 
 		 528 aa  525  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  44.63 
 
 		 521 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  45.23 
 
 		 521 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  44.65 
 
 		 521 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2662  acyl-CoA synthetase  44.28 
 
 		 521 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0929684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  44.44 
 
 		 521 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  43.87 
 
 		 523 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  42.37 
 
 		 529 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  42.45 
 
 		 531 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  42.77 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  42.06 
 
 		 520 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  41.45 
 
 		 520 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  39.69 
 
 		 512 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  37.31 
 
 		 514 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  37.93 
 
 		 521 aa  312  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 		 512 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 517 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 		 534 aa  290  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 		 516 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 519 aa  289  9e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  40.93 
 
 		 517 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  40.93 
 
 		 517 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  36.15 
 
 		 519 aa  286  7e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  40.73 
 
 		 517 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 516 aa  286  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 		 521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 		 517 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  41.62 
 
 		 519 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 		 515 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  34.78 
 
 		 565 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 		 516 aa  283  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 515 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3499  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 715 aa  280  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0487317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 		 518 aa  280  6e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 		 524 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 518 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  35.94 
 
 		 520 aa  276  7e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 517 aa  276  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 534 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 504 aa  274  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 518 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 		 515 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 		 526 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 519 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 517 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 518 aa  269  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5381  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 510 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 		 518 aa  266  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 518 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0798  AMP-dependent synthetase and ligase  38.5 
 
 		 499 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 		 509 aa  263  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 		 505 aa  263  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.396047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 511 aa  261  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 532 aa  261  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2871  AMP-dependent synthetase and ligase  41.48 
 
 		 521 aa  260  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 515 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 523 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 		 508 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 515 aa  257  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 498 aa  256  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 		 514 aa  256  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 518 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 518 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 502 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 508 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 508 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.16 
 
 		 525 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 515 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 		 517 aa  251  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0700  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 505 aa  251  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.232219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 515 aa  250  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 515 aa  250  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 		 536 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 551 aa  249  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 494 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.02 
 
 		 519 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 520 aa  247  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 525 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  31.78 
 
 		 532 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 519 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4412  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 494 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4499  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 494 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.927408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  30.74 
 
 		 545 aa  246  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.71 
 
 		 525 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.26 
 
 		 525 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 		 502 aa  243  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.51 
 
 		 526 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4968  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 489 aa  242  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2461  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 504 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.12 
 
 		 503 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>