More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1638 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 892 aa  675    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  62.1 
 
 		 900 aa  1167    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 899 aa  659    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 892 aa  637    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 910 aa  657    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 926 aa  635    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 892 aa  644    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 892 aa  642    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 892 aa  700    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 892 aa  638    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 924 aa  643    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 892 aa  694    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 904 aa  1853    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 896 aa  686    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 913 aa  629  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 914 aa  627  1e-178  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 882 aa  619  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 907 aa  621  1e-176  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 926 aa  618  1e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 923 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 915 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 926 aa  601  1e-170  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 916 aa  600  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 913 aa  600  1e-170  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 925 aa  594  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 923 aa  582  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 913 aa  582  1e-164  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 889 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 887 aa  290  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 876 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 897 aa  284  7.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 891 aa  278  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 896 aa  278  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 		 884 aa  278  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 876 aa  278  5e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1957  alanyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 		 884 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103878  normal  0.2106 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2579  alanyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 		 913 aa  275  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159446  normal  0.328441 
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 885 aa  274  5.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1987  alanyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 		 885 aa  274  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363624  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2557  alanyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 887 aa  273  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5834  alanyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 886 aa  273  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 		 891 aa  273  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1164  alanyl-tRNA synthetase  28.59 
 
 		 885 aa  271  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.855181  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 863 aa  271  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 874 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4372  alanyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 		 889 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5505  alanyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 		 886 aa  269  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195836  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2626  alanyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 891 aa  269  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.643973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3523  alanyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 		 895 aa  266  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0021732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5607  alanyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 892 aa  266  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.346592  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 891 aa  263  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 885 aa  263  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 865 aa  262  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 860 aa  261  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 		 890 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 870 aa  261  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 874 aa  261  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 		 878 aa  260  7e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 883 aa  260  9e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 883 aa  259  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 		 865 aa  260  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 880 aa  259  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 891 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 880 aa  259  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 877 aa  259  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2821  alanyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 891 aa  259  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29967  normal  0.126573 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0936  alanyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 		 870 aa  259  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 		 900 aa  259  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 		 878 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2372  alanyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 		 883 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726035  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0728  alanyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 886 aa  258  3e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.846267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 		 878 aa  258  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 		 880 aa  257  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 		 880 aa  257  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 		 880 aa  257  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 880 aa  257  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 880 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2405  alanyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 901 aa  256  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.665825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 880 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 880 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 		 880 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4468  alanyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 880 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190216 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 880 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 		 878 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  25.72 
 
 		 885 aa  254  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 889 aa  254  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 		 880 aa  254  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 875 aa  254  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 860 aa  253  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0451  alanyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 		 883 aa  253  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 877 aa  253  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1266  alanyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 909 aa  252  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2104  alanyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 883 aa  252  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653271  normal  0.762887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 874 aa  251  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 		 874 aa  251  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 878 aa  250  7e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 864 aa  250  9e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 		 881 aa  249  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  26.13 
 
 		 875 aa  249  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1023  alanyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 865 aa  249  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>