More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0809 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 280 aa  575  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  80 
 
 		 278 aa  463  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.41 
 
 		 276 aa  351  8e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  51 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.59 
 
 		 254 aa  262  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  45.49 
 
 		 263 aa  258  9e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  47.49 
 
 		 271 aa  256  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  46.8 
 
 		 264 aa  251  7e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.85 
 
 		 279 aa  250  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.8 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  49.22 
 
 		 257 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  48.62 
 
 		 283 aa  249  5e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.92 
 
 		 259 aa  248  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  46.25 
 
 		 253 aa  248  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.6 
 
 		 264 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.21 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  47.41 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  48.4 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  46.85 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.22 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  47.62 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  45.6 
 
 		 264 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  47.22 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  47.04 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  44.71 
 
 		 260 aa  235  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.63 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  46.37 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  45.85 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  47.81 
 
 		 253 aa  231  9e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 		 256 aa  228  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  45.67 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 		 255 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.02 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.63 
 
 		 262 aa  225  6e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  45.16 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  41.94 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  43.8 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.53 
 
 		 259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  42.69 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  44.71 
 
 		 258 aa  215  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  42.25 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  45.12 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  41.86 
 
 		 265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.78 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  43.07 
 
 		 262 aa  205  8e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  45.3 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.64 
 
 		 233 aa  202  7e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  39.02 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.48 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.73 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.25 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  40.65 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.08 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  38.82 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  38.85 
 
 		 276 aa  195  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  39.03 
 
 		 291 aa  195  6e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  38.85 
 
 		 288 aa  194  9e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  39.18 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  39.59 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  36.33 
 
 		 276 aa  192  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  40.17 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  39.92 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.84 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  39.33 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  36.53 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  40.68 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.48 
 
 		 252 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  41.63 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.35 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1157  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.8 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.75 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.75 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1319  undecaprenyl diphosphate synthase  41.6 
 
 		 238 aa  189  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000351697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.75 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.75 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.65 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.75 
 
 		 258 aa  188  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.65 
 
 		 263 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.17 
 
 		 258 aa  188  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1777  undecaprenyl diphosphate synthase  42.37 
 
 		 238 aa  188  9e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.33 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.33 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.33 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.67 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0348  undecaprenyl diphosphate synthase  41.53 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.33 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.45 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.42 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  37.45 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.33 
 
 		 258 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.34 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.34 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.42 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  38.34 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11438  predicted protein  38.74 
 
 		 247 aa  185  7e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178302  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.7 
 
 		 267 aa  185  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  39.54 
 
 		 289 aa  185  8e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>