More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5235 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 571 aa  1132    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  58.94 
 
 		 588 aa  552  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5589  sensor histidine kinase  34.27 
 
 		 632 aa  260  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 553 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 		 577 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  49.06 
 
 		 840 aa  192  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 		 586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 		 850 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 		 713 aa  181  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  49.75 
 
 		 384 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  46.6 
 
 		 349 aa  176  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 		 725 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 		 601 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  45.85 
 
 		 409 aa  171  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 		 346 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 713 aa  169  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  45.54 
 
 		 717 aa  169  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  32.98 
 
 		 561 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 		 344 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 662 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  43.93 
 
 		 583 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 		 583 aa  164  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 		 339 aa  163  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 		 907 aa  163  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  44.55 
 
 		 481 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  48.94 
 
 		 738 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  30.44 
 
 		 505 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  44.66 
 
 		 872 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 		 503 aa  160  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 583 aa  160  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 		 304 aa  160  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 346 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 571 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  43.37 
 
 		 733 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  44.28 
 
 		 488 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 489 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  41.1 
 
 		 1170 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  42.44 
 
 		 1160 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 		 488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 		 759 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  41.1 
 
 		 1170 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  43.9 
 
 		 842 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  44.16 
 
 		 728 aa  153  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  41.67 
 
 		 333 aa  153  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  44.9 
 
 		 1190 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 728 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  40.18 
 
 		 1165 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  41.67 
 
 		 478 aa  151  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 		 555 aa  151  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  42.92 
 
 		 261 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 258 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 829 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 		 488 aa  148  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  42.29 
 
 		 488 aa  148  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  42.65 
 
 		 460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 		 341 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 		 897 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  40.1 
 
 		 480 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 		 489 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 929 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  42.49 
 
 		 847 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  42.86 
 
 		 846 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  42.49 
 
 		 847 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 		 677 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  40.51 
 
 		 1027 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  41.55 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 631 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  39.71 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 		 642 aa  139  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 336 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.1 
 
 		 847 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  36.63 
 
 		 332 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 275 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 930 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 336 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40 
 
 		 844 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 934 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 		 582 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 336 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  45.73 
 
 		 901 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  38.94 
 
 		 930 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 1002 aa  134  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 512 aa  133  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.8 
 
 		 1167 aa  133  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  36.45 
 
 		 499 aa  133  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2070  signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 358 aa  133  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315094  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2176  putative signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  38.17 
 
 		 703 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  39.61 
 
 		 852 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 1016 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 		 1001 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 380 aa  131  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>