More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2090 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
372 aa  762    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
713 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
725 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 
409 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  41.94 
 
 
717 aa  219  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
713 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  70.37 
 
 
999 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  47.77 
 
 
872 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 
488 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 
850 aa  203  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 
586 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
738 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 
339 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
929 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
662 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
1191 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
489 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  48.64 
 
 
759 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  50.48 
 
 
840 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
571 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 
582 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  66.41 
 
 
1086 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  46.36 
 
 
577 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  39.68 
 
 
1190 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 
601 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  64.06 
 
 
1086 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  64.06 
 
 
1092 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  35.19 
 
 
728 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
728 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
341 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 
481 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 
934 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 
930 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 
897 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
907 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  35.54 
 
 
1160 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2070  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315094  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  48.22 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  44.81 
 
 
930 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  34.97 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 
571 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  39.84 
 
 
460 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
583 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.62 
 
 
1167 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
602 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  44.04 
 
 
505 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 
588 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  46.38 
 
 
346 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  48.76 
 
 
384 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1635  signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
362 aa  169  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.466466  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
488 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 
346 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
583 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  36.05 
 
 
583 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 
677 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 
413 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 
304 aa  166  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
733 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
258 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 
344 aa  162  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 
503 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
500 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
380 aa  162  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
1016 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
488 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  39.73 
 
 
842 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  43.75 
 
 
488 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
1001 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  43.72 
 
 
1041 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
642 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
489 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
489 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
491 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  43.41 
 
 
561 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 
901 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
507 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  42.11 
 
 
261 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 
512 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  46.73 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
482 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  33.44 
 
 
326 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  45.97 
 
 
1002 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  44.72 
 
 
364 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  37.14 
 
 
463 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  31.8 
 
 
483 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
336 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  37.14 
 
 
463 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
512 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
336 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
336 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  32.97 
 
 
1027 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  42.36 
 
 
849 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
575 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  37.6 
 
 
480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  35.74 
 
 
499 aa  146  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>