More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5246 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5246  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 309 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5173  carbohydrate kinase, YjeF related protein  80.34 
 
 		 298 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235734  normal  0.234925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4707  carbohydrate kinase, YjeF related protein  80.34 
 
 		 298 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0742  carbohydrate kinase, YjeF related protein  62.02 
 
 		 296 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3050  carbohydrate kinase, YjeF related protein  59.32 
 
 		 292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0182  hypothetical protein  45.52 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3700  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.95 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.562936  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0119  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.96 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1301  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.58 
 
 		 296 aa  150  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0119511  decreased coverage  0.000369396 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.29 
 
 		 516 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  38.29 
 
 		 522 aa  135  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3037  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.14 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.974968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.25 
 
 		 510 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.32 
 
 		 517 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.8 
 
 		 515 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  37.05 
 
 		 512 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.27 
 
 		 519 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  35.51 
 
 		 512 aa  126  6e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  33.33 
 
 		 524 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.58 
 
 		 533 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.72 
 
 		 524 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.42 
 
 		 556 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.97 
 
 		 499 aa  123  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.56 
 
 		 556 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  34.4 
 
 		 517 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2235  hypothetical protein  31.1 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  38.18 
 
 		 530 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  32.57 
 
 		 513 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.07 
 
 		 516 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.95 
 
 		 530 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  37.15 
 
 		 499 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.76 
 
 		 509 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  36.61 
 
 		 497 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  35.79 
 
 		 514 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  34.15 
 
 		 498 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.75 
 
 		 495 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.4 
 
 		 524 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  36.36 
 
 		 514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.98 
 
 		 520 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.5 
 
 		 512 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.91 
 
 		 513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.94 
 
 		 514 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.29 
 
 		 567 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.71 
 
 		 513 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  35.35 
 
 		 510 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.65 
 
 		 512 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02084  carbohydrate kinase superfamily  47.89 
 
 		 206 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.86 
 
 		 528 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.96 
 
 		 487 aa  111  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.93 
 
 		 499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.76 
 
 		 546 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.14 
 
 		 533 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.41 
 
 		 511 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  30.95 
 
 		 508 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  32.11 
 
 		 493 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4690  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.93 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.993931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.47 
 
 		 501 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1090  YjeF-related protein-like  35.94 
 
 		 526 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.393825  normal  0.597478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.57 
 
 		 524 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  35.66 
 
 		 519 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.21 
 
 		 523 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.25 
 
 		 485 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.68 
 
 		 518 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.09 
 
 		 532 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.4 
 
 		 531 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.46 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.14 
 
 		 521 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1254  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.2 
 
 		 574 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  32.19 
 
 		 503 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.93 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.93 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.64 
 
 		 506 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  31.77 
 
 		 493 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  36.18 
 
 		 500 aa  106  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.19 
 
 		 508 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  34.9 
 
 		 499 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.3 
 
 		 520 aa  106  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.27 
 
 		 533 aa  106  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.87 
 
 		 525 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.94 
 
 		 501 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  34.47 
 
 		 506 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.15 
 
 		 494 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.98 
 
 		 490 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.08 
 
 		 459 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  31.77 
 
 		 512 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.25 
 
 		 502 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.69 
 
 		 479 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  27.95 
 
 		 511 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  35.17 
 
 		 499 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.03 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479254  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  35.29 
 
 		 531 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.36 
 
 		 487 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.14 
 
 		 514 aa  102  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  34.75 
 
 		 496 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.11 
 
 		 504 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  27.3 
 
 		 499 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  36.55 
 
 		 533 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.24 
 
 		 528 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.9 
 
 		 498 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.9 
 
 		 500 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>