More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4707 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4707  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 298 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5173  carbohydrate kinase, YjeF related protein  96.98 
 
 		 298 aa  551  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235734  normal  0.234925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5246  carbohydrate kinase, YjeF related protein  80.34 
 
 		 309 aa  391  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0742  carbohydrate kinase, YjeF related protein  61.67 
 
 		 296 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3050  carbohydrate kinase, YjeF related protein  60.82 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0182  hypothetical protein  47.04 
 
 		 293 aa  212  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3700  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.32 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.562936  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0119  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.09 
 
 		 324 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1301  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.82 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0119511  decreased coverage  0.000369396 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.8 
 
 		 516 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3037  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.19 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.974968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.46 
 
 		 510 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  36.88 
 
 		 498 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.11 
 
 		 515 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  36.17 
 
 		 512 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  34.3 
 
 		 517 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  36.36 
 
 		 522 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  35.61 
 
 		 512 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  34.75 
 
 		 524 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.08 
 
 		 519 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.25 
 
 		 499 aa  125  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.87 
 
 		 533 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.19 
 
 		 516 aa  122  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.98 
 
 		 517 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.72 
 
 		 524 aa  121  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.73 
 
 		 528 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.97 
 
 		 509 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.14 
 
 		 512 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.81 
 
 		 530 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.56 
 
 		 513 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2235  hypothetical protein  30.23 
 
 		 312 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.46 
 
 		 520 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.83 
 
 		 513 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.4 
 
 		 530 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  33.56 
 
 		 510 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  36.4 
 
 		 499 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.89 
 
 		 487 aa  115  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  33.56 
 
 		 514 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.87 
 
 		 524 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02084  carbohydrate kinase superfamily  47.42 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.06 
 
 		 514 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.59 
 
 		 495 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.45 
 
 		 490 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  32.63 
 
 		 493 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.15 
 
 		 521 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  32.98 
 
 		 493 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  36 
 
 		 497 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.69 
 
 		 556 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.4 
 
 		 523 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.78 
 
 		 533 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.23 
 
 		 504 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.5 
 
 		 501 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.67 
 
 		 499 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.54 
 
 		 524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.77 
 
 		 520 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.15 
 
 		 556 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.13 
 
 		 501 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  27.68 
 
 		 499 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  34.75 
 
 		 499 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.41 
 
 		 512 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  33.22 
 
 		 508 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.56 
 
 		 506 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.01 
 
 		 511 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  31.88 
 
 		 499 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.82 
 
 		 511 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  34.31 
 
 		 531 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  36.26 
 
 		 490 aa  106  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  32.63 
 
 		 514 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.06 
 
 		 494 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.22 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.31 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.66 
 
 		 546 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.4 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.84 
 
 		 490 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  30.17 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  27.9 
 
 		 499 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1090  YjeF-related protein-like  39.53 
 
 		 526 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.393825  normal  0.597478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.94 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479254  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.1 
 
 		 493 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.26 
 
 		 492 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.37 
 
 		 524 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  34.14 
 
 		 436 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  32.59 
 
 		 503 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4690  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.57 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.993931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  38.22 
 
 		 487 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.4 
 
 		 492 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.61 
 
 		 521 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.82 
 
 		 498 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40 
 
 		 501 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.47 
 
 		 531 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.09 
 
 		 502 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.8 
 
 		 518 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.87 
 
 		 513 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  30.55 
 
 		 506 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.38 
 
 		 508 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.79 
 
 		 527 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.48 
 
 		 511 aa  102  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  34.96 
 
 		 519 aa  102  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 533 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  37.34 
 
 		 499 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>