260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02084 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02084  carbohydrate kinase superfamily  100 
 
 
206 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5173  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.89 
 
 
298 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235734  normal  0.234925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4707  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.89 
 
 
298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0182  hypothetical protein  41.55 
 
 
293 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5246  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.17 
 
 
309 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3700  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.15 
 
 
299 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.562936  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3050  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.23 
 
 
292 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0742  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.89 
 
 
296 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1301  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.2 
 
 
296 aa  89  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0119511  decreased coverage  0.000369396 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1386  hypothetical protein  29.77 
 
 
521 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.35 
 
 
512 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.66 
 
 
524 aa  80.1  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14891  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  28.24 
 
 
521 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.82 
 
 
509 aa  75.9  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.18 
 
 
516 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14751  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  28.24 
 
 
521 aa  75.1  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.22 
 
 
490 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  28.64 
 
 
499 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3037  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.93 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.974968 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.96 
 
 
518 aa  72.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  33.33 
 
 
512 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4690  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.5 
 
 
286 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.993931  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.67 
 
 
307 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686463  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.67 
 
 
286 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14511  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  29.38 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.723314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.16 
 
 
514 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  37.63 
 
 
519 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  31.31 
 
 
512 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  32.66 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.67 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479254  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  32.66 
 
 
510 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.92 
 
 
510 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.51 
 
 
512 aa  69.3  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.79 
 
 
515 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.46 
 
 
511 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
520 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  28.86 
 
 
498 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  34.95 
 
 
499 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  27.67 
 
 
499 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  31.34 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.11 
 
 
499 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.27 
 
 
527 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.76 
 
 
530 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.67 
 
 
514 aa  67.4  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  33.73 
 
 
493 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19611  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  33.33 
 
 
533 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  33.33 
 
 
493 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  32.16 
 
 
500 aa  65.5  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.07 
 
 
492 aa  65.5  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.18 
 
 
511 aa  65.1  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  32.78 
 
 
502 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0119  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.51 
 
 
324 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.48 
 
 
521 aa  64.7  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  37.84 
 
 
496 aa  64.7  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  33.86 
 
 
514 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.64 
 
 
499 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  33 
 
 
504 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17101  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  29.7 
 
 
563 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.343407  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2547  YjeF-related protein  24.87 
 
 
271 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13371  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  30.56 
 
 
524 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  34.15 
 
 
499 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  33 
 
 
504 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.78 
 
 
516 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  33 
 
 
504 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.44 
 
 
513 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0995  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.77 
 
 
531 aa  62.8  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  34.46 
 
 
496 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0857  hypothetical protein  29.56 
 
 
517 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.724628  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  31.94 
 
 
497 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.95 
 
 
521 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.73 
 
 
490 aa  62.8  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  28.86 
 
 
515 aa  62.4  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  28.86 
 
 
510 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.86 
 
 
515 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  28.86 
 
 
510 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  28.86 
 
 
515 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  28.86 
 
 
510 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  28.86 
 
 
515 aa  62  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  28.86 
 
 
515 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  28.86 
 
 
515 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.3 
 
 
496 aa  61.6  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2660  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.86 
 
 
513 aa  60.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00741118  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0878  hypothetical protein  31.25 
 
 
507 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  31.31 
 
 
513 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.77 
 
 
528 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  29.5 
 
 
514 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  29.5 
 
 
514 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  29.5 
 
 
514 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  34.45 
 
 
530 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1502  hypothetical protein  38.69 
 
 
509 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16359  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  34.95 
 
 
499 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  29.5 
 
 
514 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.02 
 
 
499 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  29.5 
 
 
514 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0758  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.18 
 
 
498 aa  59.3  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0354907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.34 
 
 
508 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.98 
 
 
533 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.42 
 
 
494 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.21 
 
 
459 aa  59.3  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  31.77 
 
 
533 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>