More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0758 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0758  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
498 aa  1004    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0354907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0072  carbohydrate kinase, YjeF related protein  60.88 
 
 
501 aa  578  1e-164  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.03 
 
 
514 aa  353  4e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.55 
 
 
507 aa  352  7e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.23 
 
 
504 aa  351  1e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.46 
 
 
542 aa  346  4e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.24 
 
 
501 aa  344  2e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.37 
 
 
462 aa  293  6e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2405  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.91 
 
 
478 aa  291  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104844  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.35 
 
 
483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  36.25 
 
 
481 aa  280  6e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1235  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.02 
 
 
482 aa  276  8e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00615219 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  39.13 
 
 
502 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0296  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.36 
 
 
520 aa  249  9e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.34818  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.07 
 
 
501 aa  234  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1257  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32 
 
 
504 aa  229  8e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.273999  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2450  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.73 
 
 
477 aa  229  8e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0699  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.13 
 
 
504 aa  229  8e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.55 
 
 
524 aa  229  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0518  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.2 
 
 
493 aa  227  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.076332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.08 
 
 
519 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1346  hypothetical protein  34.02 
 
 
458 aa  225  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.212301  hitchhiker  0.000869519 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1419  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.54 
 
 
503 aa  225  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.228838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.72 
 
 
515 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1827  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.89 
 
 
480 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.42 
 
 
530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.84 
 
 
525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
521 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2531  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.34 
 
 
450 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2277  hypothetical protein  34.76 
 
 
479 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  34.82 
 
 
522 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.59 
 
 
533 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.03 
 
 
528 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.93 
 
 
498 aa  211  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.12 
 
 
500 aa  209  8e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.43 
 
 
513 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.42 
 
 
510 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.27 
 
 
492 aa  207  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  34.43 
 
 
514 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.98 
 
 
517 aa  206  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1683  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.16 
 
 
467 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.87 
 
 
504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.4 
 
 
490 aa  202  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.2 
 
 
514 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1267  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.95 
 
 
505 aa  201  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.38 
 
 
521 aa  199  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  31.54 
 
 
517 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.84 
 
 
499 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  32.5 
 
 
530 aa  197  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.99 
 
 
511 aa  196  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.67 
 
 
518 aa  196  9e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  34.58 
 
 
519 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  30.32 
 
 
499 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  30.63 
 
 
498 aa  195  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.98 
 
 
492 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  30.63 
 
 
512 aa  194  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.4 
 
 
499 aa  193  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  31.24 
 
 
514 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.8 
 
 
520 aa  192  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  31.44 
 
 
514 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  31.24 
 
 
514 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  31.24 
 
 
514 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  31.24 
 
 
514 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.09 
 
 
479 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.23 
 
 
533 aa  189  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.51 
 
 
532 aa  187  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  31.46 
 
 
486 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.58 
 
 
492 aa  187  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  31.42 
 
 
499 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.51 
 
 
516 aa  187  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.63 
 
 
521 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.17 
 
 
502 aa  187  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  31.34 
 
 
488 aa  187  5e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  29.98 
 
 
496 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.95 
 
 
524 aa  186  7e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  29.7 
 
 
510 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  29.04 
 
 
499 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.77 
 
 
499 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.7 
 
 
515 aa  183  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  29.55 
 
 
510 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  30.85 
 
 
514 aa  182  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  31.73 
 
 
503 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  29.49 
 
 
515 aa  182  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  30.14 
 
 
496 aa  182  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  29.49 
 
 
515 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.21 
 
 
494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  29.49 
 
 
510 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  29.49 
 
 
515 aa  180  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.79 
 
 
509 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  30.32 
 
 
496 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.21 
 
 
494 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  29.29 
 
 
515 aa  179  8e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  29.29 
 
 
515 aa  179  8e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.75 
 
 
499 aa  179  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.47 
 
 
492 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.75 
 
 
499 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.01 
 
 
494 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  32.68 
 
 
436 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.01 
 
 
494 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  28.31 
 
 
511 aa  176  6e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>