More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0366 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  100 
 
 		 502 aa  1005    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  54.22 
 
 		 481 aa  524  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.5 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.48 
 
 		 514 aa  348  2e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.48 
 
 		 504 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.74 
 
 		 483 aa  339  5.9999999999999996e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2405  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.55 
 
 		 478 aa  325  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.42 
 
 		 507 aa  324  2e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1235  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.94 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00615219 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.13 
 
 		 501 aa  319  9e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.26 
 
 		 542 aa  315  1.9999999999999998e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2450  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.25 
 
 		 477 aa  310  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0518  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.73 
 
 		 493 aa  291  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.076332  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0072  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.95 
 
 		 501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2531  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.51 
 
 		 450 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0758  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.13 
 
 		 498 aa  280  5e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0354907 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1346  hypothetical protein  39.75 
 
 		 458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.212301  hitchhiker  0.000869519 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1683  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.87 
 
 		 467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1827  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.29 
 
 		 480 aa  258  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2277  hypothetical protein  38.38 
 
 		 479 aa  256  9e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0699  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 		 504 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239706  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1419  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 503 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.228838  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1257  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 		 504 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.273999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0296  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 		 520 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.34818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.44 
 
 		 519 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.62 
 
 		 510 aa  233  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.14 
 
 		 530 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  33.46 
 
 		 517 aa  219  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.66 
 
 		 509 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.4 
 
 		 530 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1267  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.81 
 
 		 505 aa  217  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.06 
 
 		 516 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.46 
 
 		 532 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.82 
 
 		 498 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.27 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  34.95 
 
 		 522 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  34.93 
 
 		 514 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.78 
 
 		 500 aa  206  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.7 
 
 		 525 aa  206  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.87 
 
 		 517 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.53 
 
 		 504 aa  204  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 		 533 aa  202  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.16 
 
 		 513 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.14 
 
 		 501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.79 
 
 		 492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.44 
 
 		 514 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.56 
 
 		 521 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.65 
 
 		 499 aa  196  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.72 
 
 		 499 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.3 
 
 		 492 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.13 
 
 		 499 aa  196  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  33.74 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.73 
 
 		 502 aa  194  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.47 
 
 		 494 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.3 
 
 		 511 aa  194  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.79 
 
 		 499 aa  192  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.26 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.75 
 
 		 524 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.47 
 
 		 494 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.43 
 
 		 479 aa  189  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.44 
 
 		 502 aa  189  9e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.85 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.06 
 
 		 494 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  31.7 
 
 		 512 aa  187  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.29 
 
 		 523 aa  186  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.69 
 
 		 488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  31.81 
 
 		 512 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  34.56 
 
 		 519 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.23 
 
 		 528 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  32.3 
 
 		 492 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  30.17 
 
 		 499 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.71 
 
 		 533 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.28 
 
 		 492 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.56 
 
 		 506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  31.28 
 
 		 496 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.93 
 
 		 539 aa  180  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  30.59 
 
 		 498 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1145  YjeF-related protein-like protein  33.2 
 
 		 495 aa  178  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0478432  normal  0.107568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.54 
 
 		 508 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.49 
 
 		 524 aa  177  3e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  32.89 
 
 		 512 aa  176  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.24 
 
 		 530 aa  176  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.43 
 
 		 518 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  30.77 
 
 		 513 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  31.23 
 
 		 488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  33.2 
 
 		 503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.7 
 
 		 521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  33.19 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  29.79 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.52 
 
 		 515 aa  172  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.82 
 
 		 499 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  31.35 
 
 		 524 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  31.52 
 
 		 510 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.26 
 
 		 512 aa  171  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.53 
 
 		 490 aa  171  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  31.38 
 
 		 510 aa  171  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  30.94 
 
 		 513 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.81 
 
 		 528 aa  169  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  31.31 
 
 		 515 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>