More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1091 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
462 aa  910    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  50.5 
 
 
502 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  49.49 
 
 
481 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.1 
 
 
483 aa  382  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2405  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.84 
 
 
478 aa  347  3e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104844  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1235  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.93 
 
 
482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00615219 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2450  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.17 
 
 
477 aa  322  6e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.43 
 
 
514 aa  318  1e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.17 
 
 
504 aa  315  9e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.69 
 
 
507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0518  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.84 
 
 
493 aa  301  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.076332  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.01 
 
 
542 aa  300  3e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.65 
 
 
501 aa  299  9e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0758  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.37 
 
 
498 aa  287  2.9999999999999996e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0354907 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1827  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.6 
 
 
480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2277  hypothetical protein  42.22 
 
 
479 aa  280  4e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1257  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.38 
 
 
504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.273999  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0296  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.1 
 
 
520 aa  273  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.34818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2531  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.48 
 
 
450 aa  273  6e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0072  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.56 
 
 
501 aa  268  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1346  hypothetical protein  40.53 
 
 
458 aa  269  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.212301  hitchhiker  0.000869519 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1683  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.78 
 
 
467 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0699  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.15 
 
 
504 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239706  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1267  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.67 
 
 
505 aa  247  4e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1419  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.95 
 
 
503 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.228838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.38 
 
 
519 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.21 
 
 
501 aa  231  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.92 
 
 
510 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.38 
 
 
530 aa  223  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.27 
 
 
498 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.6 
 
 
502 aa  219  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.84 
 
 
516 aa  217  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.09 
 
 
479 aa  216  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.6 
 
 
492 aa  216  9e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.07 
 
 
500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.94 
 
 
515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.52 
 
 
530 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.19 
 
 
509 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.24 
 
 
521 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  35.36 
 
 
522 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  30.37 
 
 
517 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.69 
 
 
511 aa  200  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.08 
 
 
524 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.6 
 
 
504 aa  195  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.21 
 
 
532 aa  194  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.15 
 
 
524 aa  194  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.69 
 
 
524 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.72 
 
 
525 aa  190  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.2 
 
 
520 aa  189  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.14 
 
 
517 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.94 
 
 
514 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
518 aa  188  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33 
 
 
506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.43 
 
 
533 aa  180  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.57 
 
 
533 aa  180  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  30.99 
 
 
524 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0691  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.64 
 
 
287 aa  177  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.18 
 
 
524 aa  176  5e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
513 aa  177  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.08 
 
 
493 aa  176  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.75 
 
 
487 aa  176  8e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.63 
 
 
490 aa  176  9e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  31.37 
 
 
498 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  29.48 
 
 
499 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  31.52 
 
 
514 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.15 
 
 
502 aa  173  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.14 
 
 
528 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.57 
 
 
492 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  29.42 
 
 
499 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  33.98 
 
 
519 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.61 
 
 
523 aa  170  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  32.63 
 
 
492 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.81 
 
 
500 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.94 
 
 
501 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  28.76 
 
 
499 aa  167  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.66 
 
 
528 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2039  carbohydrate kinase YjeF-like protein  32.06 
 
 
490 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  28.37 
 
 
511 aa  164  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.6 
 
 
521 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  32.36 
 
 
510 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.36 
 
 
515 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  32.04 
 
 
510 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  33.12 
 
 
514 aa  160  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  32.77 
 
 
492 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  31.94 
 
 
515 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  31.94 
 
 
515 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  32.15 
 
 
515 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  31.94 
 
 
515 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  31.52 
 
 
512 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.3 
 
 
527 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.5 
 
 
516 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  31.94 
 
 
515 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  29.92 
 
 
524 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  31.94 
 
 
510 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  32.18 
 
 
496 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.6 
 
 
514 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  32.38 
 
 
510 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.12 
 
 
499 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.42 
 
 
499 aa  156  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  32.06 
 
 
486 aa  156  6e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>