More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2531 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2531  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
450 aa  890    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1683  carbohydrate kinase, YjeF related protein  60.14 
 
 
467 aa  479  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1827  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57.08 
 
 
480 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2277  hypothetical protein  54.5 
 
 
479 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1346  hypothetical protein  47.56 
 
 
458 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.212301  hitchhiker  0.000869519 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  39.92 
 
 
481 aa  297  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  42.51 
 
 
502 aa  285  8e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.48 
 
 
462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.22 
 
 
483 aa  279  8e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.79 
 
 
504 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.37 
 
 
514 aa  267  4e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.44 
 
 
507 aa  266  5e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.25 
 
 
501 aa  260  4e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2405  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.25 
 
 
478 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104844  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0072  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.8 
 
 
501 aa  238  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1235  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.47 
 
 
482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00615219 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0699  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.6 
 
 
504 aa  227  4e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239706  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0296  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.46 
 
 
520 aa  226  7e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.34818  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.07 
 
 
542 aa  225  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0758  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.34 
 
 
498 aa  223  4e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0354907 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1257  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.6 
 
 
504 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.273999  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1267  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.17 
 
 
505 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1419  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.11 
 
 
503 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.228838  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2450  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.91 
 
 
477 aa  211  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0518  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.96 
 
 
493 aa  204  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.076332  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.75 
 
 
479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.14 
 
 
513 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.15 
 
 
500 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.88 
 
 
519 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  32.49 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  32.24 
 
 
496 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.63 
 
 
502 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  30.43 
 
 
517 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.7 
 
 
532 aa  151  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.13 
 
 
530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  32.38 
 
 
496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2039  carbohydrate kinase YjeF-like protein  31.25 
 
 
490 aa  147  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  31.2 
 
 
514 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.95 
 
 
490 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  30.6 
 
 
514 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.64 
 
 
501 aa  144  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  30.6 
 
 
514 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  30.6 
 
 
514 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.91 
 
 
510 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  30.4 
 
 
514 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.6 
 
 
498 aa  143  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.96 
 
 
509 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.75 
 
 
524 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.1 
 
 
502 aa  142  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  30.66 
 
 
522 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.06 
 
 
500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  27.89 
 
 
512 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.61 
 
 
528 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  28.4 
 
 
513 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  32.94 
 
 
512 aa  138  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.04 
 
 
515 aa  137  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  29.22 
 
 
524 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.68 
 
 
521 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.45 
 
 
499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  30.56 
 
 
514 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  29.53 
 
 
504 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  29.53 
 
 
504 aa  133  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.19 
 
 
525 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.18 
 
 
533 aa  132  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  29.33 
 
 
504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  30.15 
 
 
510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0691  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.68 
 
 
287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  31.85 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.74 
 
 
517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.72 
 
 
512 aa  131  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  31.82 
 
 
500 aa  131  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  28.21 
 
 
524 aa  130  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  29.41 
 
 
510 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  29.41 
 
 
515 aa  130  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.58 
 
 
492 aa  130  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  29.21 
 
 
510 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  29.03 
 
 
510 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  31.97 
 
 
512 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  29.41 
 
 
515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.21 
 
 
515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  29.41 
 
 
515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  29.41 
 
 
515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.19 
 
 
493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.78 
 
 
499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.23 
 
 
504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.46 
 
 
499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.71 
 
 
524 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  28.97 
 
 
515 aa  127  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.27 
 
 
514 aa  127  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  31.03 
 
 
508 aa  126  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.04 
 
 
516 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  28.99 
 
 
513 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  31.44 
 
 
502 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  32.19 
 
 
502 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  30.75 
 
 
496 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.6 
 
 
499 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  30.28 
 
 
492 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.71 
 
 
539 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.1 
 
 
494 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.98 
 
 
499 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>