More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1257 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1257  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
504 aa  1006    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.273999  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0699  carbohydrate kinase, YjeF related protein  87.67 
 
 
504 aa  897    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239706  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1419  carbohydrate kinase, YjeF related protein  86.08 
 
 
503 aa  857    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.228838  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1267  carbohydrate kinase, YjeF related protein  64.97 
 
 
505 aa  638    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0296  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.5 
 
 
520 aa  444  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.34818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.38 
 
 
462 aa  263  8e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.71 
 
 
504 aa  256  5e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.47 
 
 
514 aa  256  7e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.76 
 
 
501 aa  256  7e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.91 
 
 
483 aa  250  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  33.2 
 
 
481 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1235  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.11 
 
 
482 aa  242  9e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00615219 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2405  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.64 
 
 
478 aa  237  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104844  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.91 
 
 
542 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.86 
 
 
507 aa  233  5e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  32.35 
 
 
502 aa  231  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2277  hypothetical protein  29.67 
 
 
479 aa  223  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1346  hypothetical protein  31.5 
 
 
458 aa  217  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.212301  hitchhiker  0.000869519 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1827  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.12 
 
 
480 aa  212  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0758  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32 
 
 
498 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0354907 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2531  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.19 
 
 
450 aa  211  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0072  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.99 
 
 
501 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2450  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.85 
 
 
477 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1683  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.7 
 
 
467 aa  188  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.08 
 
 
501 aa  187  5e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0518  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.05 
 
 
493 aa  186  7e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.076332  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.33 
 
 
524 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.52 
 
 
500 aa  176  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.38 
 
 
498 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.63 
 
 
518 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.5 
 
 
530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.08 
 
 
521 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.74 
 
 
514 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.53 
 
 
516 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.33 
 
 
515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.43 
 
 
524 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.88 
 
 
532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.4 
 
 
520 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  25.77 
 
 
524 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.03 
 
 
509 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.25 
 
 
504 aa  151  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.84 
 
 
517 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.21 
 
 
512 aa  151  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.65 
 
 
525 aa  150  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.28 
 
 
533 aa  150  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.98 
 
 
479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.74 
 
 
514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.98 
 
 
492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.33 
 
 
533 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  27.76 
 
 
522 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  27.18 
 
 
510 aa  144  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  23.86 
 
 
528 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  27.13 
 
 
510 aa  144  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  27.18 
 
 
515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.18 
 
 
515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  27.18 
 
 
510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  27.18 
 
 
515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  27.18 
 
 
515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.85 
 
 
519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  27.18 
 
 
515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  27.93 
 
 
517 aa  140  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.68 
 
 
513 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.08 
 
 
511 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.63 
 
 
521 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.04 
 
 
510 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  27.02 
 
 
514 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  26.98 
 
 
515 aa  137  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  26.33 
 
 
514 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  26.17 
 
 
514 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  26.17 
 
 
514 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  26.17 
 
 
514 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.84 
 
 
490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.41 
 
 
546 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.95 
 
 
516 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  23.94 
 
 
556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  26.11 
 
 
504 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.74 
 
 
524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  25.98 
 
 
530 aa  131  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  28.95 
 
 
499 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  26.24 
 
 
514 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  26.32 
 
 
504 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  29.39 
 
 
499 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  25.25 
 
 
510 aa  130  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  26.32 
 
 
504 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.99 
 
 
527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  23.36 
 
 
499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.38 
 
 
556 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  27.62 
 
 
486 aa  128  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  27.71 
 
 
488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  26.81 
 
 
513 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  22.24 
 
 
502 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.93 
 
 
524 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  25.05 
 
 
498 aa  124  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  28.24 
 
 
511 aa  124  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.48 
 
 
506 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  22.72 
 
 
490 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.85 
 
 
530 aa  123  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  26.92 
 
 
524 aa  123  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  25 
 
 
512 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0691  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.03 
 
 
287 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>