More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1827 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1827  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
480 aa  959    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1683  carbohydrate kinase, YjeF related protein  62.5 
 
 
467 aa  526  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2277  hypothetical protein  55.01 
 
 
479 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2531  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57.08 
 
 
450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1346  hypothetical protein  48.03 
 
 
458 aa  386  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.212301  hitchhiker  0.000869519 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  39.8 
 
 
481 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.18 
 
 
483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.18 
 
 
462 aa  280  3e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2405  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.8 
 
 
478 aa  265  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104844  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.87 
 
 
504 aa  261  1e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.79 
 
 
514 aa  261  2e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1235  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.87 
 
 
482 aa  250  3e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00615219 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  38.49 
 
 
502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.27 
 
 
507 aa  243  6e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.84 
 
 
501 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0296  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.29 
 
 
520 aa  234  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.34818  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.11 
 
 
542 aa  228  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2450  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.3 
 
 
477 aa  226  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0072  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.84 
 
 
501 aa  219  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0518  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.55 
 
 
493 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.076332  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0699  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.39 
 
 
504 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1257  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.12 
 
 
504 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.273999  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1267  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.48 
 
 
505 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0758  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.89 
 
 
498 aa  210  4e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0354907 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1419  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.7 
 
 
503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.228838  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.12 
 
 
479 aa  190  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.97 
 
 
490 aa  170  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.62 
 
 
510 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.54 
 
 
515 aa  166  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.08 
 
 
513 aa  163  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.82 
 
 
500 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.03 
 
 
533 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  34.34 
 
 
502 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.01 
 
 
504 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  33.13 
 
 
496 aa  156  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  33.06 
 
 
502 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  34.17 
 
 
522 aa  153  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.62 
 
 
509 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.03 
 
 
500 aa  150  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  33.61 
 
 
510 aa  149  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  33 
 
 
514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  29.16 
 
 
517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.29 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  32.16 
 
 
510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  32.8 
 
 
514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  32.8 
 
 
514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  32.8 
 
 
514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  32.8 
 
 
514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  33.01 
 
 
514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.74 
 
 
502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.79 
 
 
492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.56 
 
 
530 aa  147  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.91 
 
 
499 aa  146  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.13 
 
 
499 aa  147  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.5 
 
 
498 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  32.06 
 
 
503 aa  146  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.57 
 
 
501 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  32.16 
 
 
515 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  32.16 
 
 
515 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  32.16 
 
 
515 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  32.35 
 
 
508 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.16 
 
 
515 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  33.13 
 
 
496 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  32.16 
 
 
515 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  32.16 
 
 
510 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.2 
 
 
499 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  30.27 
 
 
504 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  30.27 
 
 
504 aa  144  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  32.16 
 
 
510 aa  143  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  30.06 
 
 
504 aa  143  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.26 
 
 
487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.81 
 
 
499 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.34 
 
 
524 aa  140  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.99 
 
 
519 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  31.61 
 
 
515 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.88 
 
 
492 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.71 
 
 
493 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  31.27 
 
 
499 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  30.08 
 
 
512 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.84 
 
 
494 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
520 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.84 
 
 
494 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.38 
 
 
492 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  35.19 
 
 
507 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  31.98 
 
 
512 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  30.88 
 
 
486 aa  137  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  34.39 
 
 
500 aa  136  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  31.09 
 
 
462 aa  136  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2039  carbohydrate kinase YjeF-like protein  30.72 
 
 
490 aa  136  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  30.36 
 
 
492 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.6 
 
 
514 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  30.56 
 
 
488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  30.43 
 
 
524 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.64 
 
 
494 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  32.72 
 
 
513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  32.02 
 
 
498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.45 
 
 
494 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.32 
 
 
521 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  29.71 
 
 
513 aa  133  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.99 
 
 
525 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>