More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0857 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0857  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1044    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.724628  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17101  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  98.26 
 
 
563 aa  1028    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.343407  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19611  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  48.24 
 
 
533 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13371  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  50.39 
 
 
524 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1386  hypothetical protein  45.14 
 
 
521 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14511  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  46.12 
 
 
522 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.723314  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14891  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  45.14 
 
 
521 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14751  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  44.14 
 
 
521 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0878  hypothetical protein  43.09 
 
 
507 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.91 
 
 
512 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.13 
 
 
523 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.2 
 
 
524 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  36.22 
 
 
508 aa  265  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  36.14 
 
 
515 aa  259  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.91 
 
 
511 aa  248  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.93 
 
 
518 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1273  hypothetical protein  34.29 
 
 
511 aa  226  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.485715  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.43 
 
 
528 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  32.92 
 
 
512 aa  157  6e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  31.5 
 
 
512 aa  156  9e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.83 
 
 
524 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.64 
 
 
510 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
512 aa  151  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  28.46 
 
 
499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.96 
 
 
556 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.82 
 
 
524 aa  146  9e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  27.89 
 
 
499 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.7 
 
 
567 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  29.04 
 
 
517 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.11 
 
 
513 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.39 
 
 
509 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.6 
 
 
517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.68 
 
 
556 aa  141  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.78 
 
 
504 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.53 
 
 
514 aa  140  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  26.31 
 
 
499 aa  140  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.72 
 
 
515 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.54 
 
 
490 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.43 
 
 
492 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.49 
 
 
546 aa  137  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.67 
 
 
530 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  26.48 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.53 
 
 
496 aa  134  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.15 
 
 
508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  28.67 
 
 
499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  26.96 
 
 
466 aa  131  3e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.94 
 
 
533 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.4 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.4 
 
 
490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.43 
 
 
511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.32 
 
 
515 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.79 
 
 
519 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.74 
 
 
529 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.96 
 
 
485 aa  128  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.14 
 
 
490 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.77 
 
 
539 aa  127  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.54 
 
 
490 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.75 
 
 
501 aa  127  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  27.04 
 
 
506 aa  126  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.84 
 
 
521 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.87 
 
 
507 aa  125  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  26.86 
 
 
524 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2660  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.83 
 
 
513 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00741118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  29.6 
 
 
530 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.82 
 
 
498 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  28.32 
 
 
493 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.71 
 
 
521 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  29.51 
 
 
504 aa  124  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1232  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.11 
 
 
496 aa  123  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271029  normal  0.25171 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.54 
 
 
495 aa  123  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  29.51 
 
 
504 aa  123  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.83 
 
 
487 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  27.03 
 
 
499 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.69 
 
 
496 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  28.77 
 
 
436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  29.27 
 
 
504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1020  YjeF-related protein-like  28.8 
 
 
525 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0522551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.88 
 
 
512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.74 
 
 
524 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  27.86 
 
 
507 aa  120  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.86 
 
 
530 aa  119  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.05 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.06 
 
 
504 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1246  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.2 
 
 
541 aa  119  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.04 
 
 
493 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.78 
 
 
542 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.31 
 
 
533 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.89 
 
 
501 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.58 
 
 
527 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.06 
 
 
514 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.98 
 
 
524 aa  118  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.38 
 
 
523 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  25.95 
 
 
510 aa  118  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  29.01 
 
 
511 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.89 
 
 
502 aa  118  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  25.76 
 
 
510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  25.95 
 
 
515 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  28.7 
 
 
510 aa  117  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1502  hypothetical protein  29.59 
 
 
509 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16359  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  29.59 
 
 
499 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>