More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0878 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0878  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1002    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19611  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  52.51 
 
 
533 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0857  hypothetical protein  42.47 
 
 
517 aa  422  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.724628  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17101  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  42.47 
 
 
563 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.343407  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1386  hypothetical protein  42.09 
 
 
521 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13371  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  47.84 
 
 
524 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14751  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  40.43 
 
 
521 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14891  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  40.32 
 
 
521 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14511  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  39.24 
 
 
522 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.723314  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.62 
 
 
512 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.6 
 
 
523 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  38.58 
 
 
515 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.58 
 
 
524 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  35.2 
 
 
508 aa  236  6e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.41 
 
 
511 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1273  hypothetical protein  39.49 
 
 
511 aa  217  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.485715  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.86 
 
 
518 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.1 
 
 
524 aa  169  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.48 
 
 
556 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.52 
 
 
556 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.4 
 
 
501 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.42 
 
 
496 aa  157  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.48 
 
 
510 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.75 
 
 
508 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.7 
 
 
496 aa  152  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  30.35 
 
 
466 aa  151  3e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
490 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.25 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.83 
 
 
524 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.86 
 
 
509 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.72 
 
 
539 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.44 
 
 
533 aa  147  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.63 
 
 
510 aa  146  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  29.1 
 
 
463 aa  145  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.76 
 
 
490 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.92 
 
 
512 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  32.02 
 
 
499 aa  144  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.61 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.48 
 
 
501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  31.54 
 
 
512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  32.11 
 
 
493 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  31.1 
 
 
501 aa  141  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  31.1 
 
 
501 aa  141  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.39 
 
 
546 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  31.28 
 
 
512 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.7 
 
 
528 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.74 
 
 
511 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  31.88 
 
 
504 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  31.88 
 
 
504 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  31.88 
 
 
504 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  30.14 
 
 
524 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.12 
 
 
519 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.69 
 
 
524 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.33 
 
 
490 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.07 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.76 
 
 
504 aa  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.51 
 
 
500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.91 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.14 
 
 
530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  30.1 
 
 
517 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.99 
 
 
490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  30.8 
 
 
499 aa  133  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  31.04 
 
 
514 aa  133  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.35 
 
 
500 aa  133  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.73 
 
 
514 aa  133  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  27.72 
 
 
499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  31.04 
 
 
510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  27.14 
 
 
499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.01 
 
 
533 aa  131  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  32.35 
 
 
533 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.81 
 
 
468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.71 
 
 
525 aa  130  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.24 
 
 
514 aa  130  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.44 
 
 
480 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.76 
 
 
515 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.18 
 
 
559 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  31.57 
 
 
530 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.53 
 
 
513 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  32.61 
 
 
462 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.26 
 
 
521 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  32.65 
 
 
513 aa  128  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.45 
 
 
487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.64 
 
 
529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.63 
 
 
457 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
513 aa  127  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.36 
 
 
495 aa  127  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.69 
 
 
523 aa  126  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  32.35 
 
 
499 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.86 
 
 
512 aa  126  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  34.1 
 
 
487 aa  126  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.27 
 
 
521 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.85 
 
 
501 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  30.46 
 
 
514 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  32.89 
 
 
497 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  33.62 
 
 
507 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  32.11 
 
 
490 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1502  hypothetical protein  34.01 
 
 
509 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16359  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.26 
 
 
524 aa  124  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  31.72 
 
 
436 aa  123  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  26.35 
 
 
511 aa  124  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>