More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1386 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_14751  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  87.72 
 
 
521 aa  920    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1386  hypothetical protein  100 
 
 
521 aa  1052    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14511  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  69.16 
 
 
522 aa  750    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.723314  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14891  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  86.18 
 
 
521 aa  899    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0857  hypothetical protein  45.14 
 
 
517 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.724628  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19611  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  43.92 
 
 
533 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17101  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  44.36 
 
 
563 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.343407  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13371  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  45.51 
 
 
524 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0878  hypothetical protein  42.01 
 
 
507 aa  395  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.59 
 
 
512 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.42 
 
 
518 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.25 
 
 
511 aa  239  8e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.5 
 
 
523 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  36.38 
 
 
515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.71 
 
 
524 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  34.64 
 
 
508 aa  231  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1273  hypothetical protein  32.79 
 
 
511 aa  202  9e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.485715  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.42 
 
 
514 aa  156  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.77 
 
 
524 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.46 
 
 
510 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.32 
 
 
490 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.38 
 
 
504 aa  146  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.41 
 
 
512 aa  143  8e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  28.73 
 
 
499 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  27.45 
 
 
466 aa  140  7e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  29.02 
 
 
499 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.21 
 
 
500 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.76 
 
 
524 aa  139  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  28.26 
 
 
463 aa  139  2e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.74 
 
 
524 aa  137  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.02 
 
 
492 aa  137  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.02 
 
 
556 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.96 
 
 
498 aa  137  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27 
 
 
516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.21 
 
 
509 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.06 
 
 
528 aa  134  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.8 
 
 
502 aa  133  9e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.54 
 
 
517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  28.22 
 
 
524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.09 
 
 
511 aa  131  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  27.48 
 
 
512 aa  130  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  28.66 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1024  YjeF-related protein-like  28.47 
 
 
528 aa  128  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1232  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.42 
 
 
496 aa  127  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271029  normal  0.25171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.45 
 
 
539 aa  127  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.16 
 
 
513 aa  127  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.05 
 
 
533 aa  127  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  28.54 
 
 
493 aa  127  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.39 
 
 
504 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.67 
 
 
501 aa  126  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.27 
 
 
490 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  27.87 
 
 
517 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.95 
 
 
515 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.69 
 
 
559 aa  124  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.08 
 
 
519 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  28.69 
 
 
499 aa  124  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.45 
 
 
556 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.98 
 
 
512 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.49 
 
 
523 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.49 
 
 
530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.21 
 
 
496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.11 
 
 
493 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.01 
 
 
508 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  26.17 
 
 
511 aa  120  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.18 
 
 
533 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.79 
 
 
546 aa  120  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  28.11 
 
 
530 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  25.39 
 
 
513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.44 
 
 
485 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.93 
 
 
507 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1020  YjeF-related protein-like  29.07 
 
 
525 aa  118  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0522551  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.87 
 
 
514 aa  118  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  28.08 
 
 
502 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  28.07 
 
 
499 aa  117  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  26.83 
 
 
514 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  29.38 
 
 
499 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.51 
 
 
521 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.45 
 
 
509 aa  116  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.11 
 
 
524 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  26.95 
 
 
512 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  27.92 
 
 
488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  26.43 
 
 
504 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  26.22 
 
 
504 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.34 
 
 
487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  28.57 
 
 
524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  26.22 
 
 
504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.15 
 
 
511 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.5 
 
 
504 aa  115  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.9 
 
 
501 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.65 
 
 
521 aa  114  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.09 
 
 
510 aa  114  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.54 
 
 
515 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  26.81 
 
 
498 aa  113  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.12 
 
 
501 aa  113  9e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  27.49 
 
 
502 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  26.71 
 
 
497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1502  hypothetical protein  29.09 
 
 
509 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16359  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  27.04 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.79 
 
 
525 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1473  conserved hypothetical protein, possible sugar kinase  30.52 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>