More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1473 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1473  conserved hypothetical protein, possible sugar kinase  100 
 
 		 448 aa  883    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0181  hypothetical protein  66.52 
 
 		 456 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0839486  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0219  hypothetical protein  66.3 
 
 		 456 aa  584  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0198  hypothetical protein  65.86 
 
 		 456 aa  580  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1785  preprotein translocase, YajC subunit  42.61 
 
 		 467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0020  YjeF-related protein  41.58 
 
 		 490 aa  292  8e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2162  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.39 
 
 		 465 aa  280  4e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1503  YjeF-related protein  39.32 
 
 		 466 aa  274  3e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00119463  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1688  YjeF-related protein  37.55 
 
 		 461 aa  260  3e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0216  hypothetical protein  36.88 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1370  YjeF-related protein  35.95 
 
 		 496 aa  216  7e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.17 
 
 		 515 aa  170  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.87 
 
 		 492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.85 
 
 		 492 aa  162  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  29.35 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.52 
 
 		 513 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  30.06 
 
 		 496 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.2 
 
 		 499 aa  159  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  29.65 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.33 
 
 		 499 aa  155  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  28.6 
 
 		 517 aa  156  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.13 
 
 		 498 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.77 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.71 
 
 		 500 aa  154  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.86 
 
 		 509 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  28.99 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.02 
 
 		 494 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.37 
 
 		 499 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.37 
 
 		 494 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  27.94 
 
 		 499 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  28.51 
 
 		 492 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.79 
 
 		 499 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  29.89 
 
 		 508 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.12 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  28.73 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  28.05 
 
 		 499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.72 
 
 		 515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.14 
 
 		 511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  29.72 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.57 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.37 
 
 		 494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  29.72 
 
 		 515 aa  147  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.79 
 
 		 504 aa  146  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  28.45 
 
 		 515 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.54 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  28.45 
 
 		 515 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  29.48 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  28.57 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.21 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  27.59 
 
 		 499 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  29.48 
 
 		 515 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.88 
 
 		 502 aa  145  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  29.48 
 
 		 515 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  29.64 
 
 		 511 aa  143  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  28.54 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.66 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.72 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.08 
 
 		 515 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.58 
 
 		 479 aa  141  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  31.53 
 
 		 482 aa  140  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  29.08 
 
 		 514 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.99 
 
 		 514 aa  139  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.68 
 
 		 532 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  28.36 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.33 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.8 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.39 
 
 		 506 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  28.84 
 
 		 514 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  27.52 
 
 		 504 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  28.84 
 
 		 514 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.8 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  28.84 
 
 		 514 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.13 
 
 		 488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  28.84 
 
 		 514 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  27.29 
 
 		 504 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.76 
 
 		 530 aa  137  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  27.52 
 
 		 504 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27 
 
 		 524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  26.1 
 
 		 510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.61 
 
 		 490 aa  133  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.32 
 
 		 487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  28.31 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  26.64 
 
 		 462 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  28.98 
 
 		 500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  24.79 
 
 		 514 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1145  YjeF-related protein-like protein  27.27 
 
 		 495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0478432  normal  0.107568 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.79 
 
 		 490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  26.77 
 
 		 522 aa  128  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  27.74 
 
 		 487 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  26.38 
 
 		 522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  29.5 
 
 		 526 aa  127  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  25.1 
 
 		 512 aa  127  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25 
 
 		 524 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.84 
 
 		 514 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.33 
 
 		 494 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.54 
 
 		 529 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.47 
 
 		 501 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.06 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  25.39 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.93 
 
 		 525 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>