More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1785 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1785  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
467 aa  944    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1503  YjeF-related protein  58.3 
 
 
466 aa  525  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00119463  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1688  YjeF-related protein  45.61 
 
 
461 aa  402  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0020  YjeF-related protein  45.25 
 
 
490 aa  393  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2162  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.07 
 
 
465 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0216  hypothetical protein  43.66 
 
 
454 aa  345  1e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1370  YjeF-related protein  41.77 
 
 
496 aa  311  2e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0219  hypothetical protein  39.75 
 
 
456 aa  299  8e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0181  hypothetical protein  39.53 
 
 
456 aa  298  2e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0839486  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1473  conserved hypothetical protein, possible sugar kinase  42.61 
 
 
448 aa  294  3e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0198  hypothetical protein  39.32 
 
 
456 aa  293  4e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.33 
 
 
515 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.28 
 
 
492 aa  187  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.4 
 
 
513 aa  180  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.45 
 
 
479 aa  178  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  29.32 
 
 
499 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.36 
 
 
492 aa  176  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  30.26 
 
 
498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.17 
 
 
524 aa  172  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  33.71 
 
 
492 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  29.82 
 
 
519 aa  170  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.99 
 
 
509 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  29.12 
 
 
499 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.8 
 
 
529 aa  170  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.57 
 
 
499 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.72 
 
 
504 aa  168  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.35 
 
 
494 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.51 
 
 
524 aa  167  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  30.58 
 
 
512 aa  167  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  30.99 
 
 
508 aa  167  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.4 
 
 
510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
499 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.12 
 
 
494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.99 
 
 
514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.1 
 
 
499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  33.03 
 
 
499 aa  164  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.32 
 
 
518 aa  164  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.89 
 
 
494 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.83 
 
 
500 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.89 
 
 
494 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  32.3 
 
 
496 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.99 
 
 
521 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  31.35 
 
 
462 aa  163  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.22 
 
 
511 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  28.84 
 
 
490 aa  162  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.97 
 
 
502 aa  161  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.33 
 
 
498 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.76 
 
 
500 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  30.84 
 
 
492 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.1 
 
 
499 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  30.48 
 
 
511 aa  160  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.9 
 
 
515 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  29.25 
 
 
496 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  29.59 
 
 
510 aa  160  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  29.59 
 
 
510 aa  159  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  29.59 
 
 
510 aa  160  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.59 
 
 
515 aa  159  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.14 
 
 
506 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  29.59 
 
 
515 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.47 
 
 
493 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  29.59 
 
 
515 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  29.59 
 
 
515 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  29.59 
 
 
515 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.78 
 
 
501 aa  157  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.02 
 
 
514 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  28.4 
 
 
514 aa  156  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  29.76 
 
 
514 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  27.64 
 
 
517 aa  156  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.16 
 
 
487 aa  156  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0069  hypothetical protein  31.43 
 
 
504 aa  155  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.09 
 
 
501 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  30.79 
 
 
488 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  29.76 
 
 
514 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  29.76 
 
 
514 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  29.76 
 
 
514 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  29.76 
 
 
514 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  29.16 
 
 
515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  31.42 
 
 
499 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.2 
 
 
507 aa  154  5e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.09 
 
 
490 aa  153  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  29.65 
 
 
513 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  30.4 
 
 
513 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  31.07 
 
 
503 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.43 
 
 
504 aa  151  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.21 
 
 
524 aa  152  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  29.76 
 
 
504 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  29.76 
 
 
504 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.35 
 
 
490 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.51 
 
 
499 aa  149  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.93 
 
 
499 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.98 
 
 
488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  29.76 
 
 
504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.31 
 
 
504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  29.1 
 
 
436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  30.67 
 
 
496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  30.57 
 
 
486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.72 
 
 
494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  30.36 
 
 
524 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.94 
 
 
525 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.47 
 
 
501 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>