More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1503 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1503  YjeF-related protein  100 
 
 		 466 aa  940    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00119463  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1785  preprotein translocase, YajC subunit  58.3 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0020  YjeF-related protein  46.99 
 
 		 490 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1688  YjeF-related protein  46.57 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2162  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.63 
 
 		 465 aa  346  6e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0216  hypothetical protein  41.56 
 
 		 454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1370  YjeF-related protein  41.12 
 
 		 496 aa  296  7e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0181  hypothetical protein  38.62 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0198  hypothetical protein  39.04 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0219  hypothetical protein  38.62 
 
 		 456 aa  280  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1473  conserved hypothetical protein, possible sugar kinase  39.1 
 
 		 448 aa  277  3e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.99 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  32.13 
 
 		 498 aa  186  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  29.44 
 
 		 499 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.05 
 
 		 492 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.02 
 
 		 513 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  28.6 
 
 		 499 aa  176  9e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.72 
 
 		 499 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.11 
 
 		 494 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  32.4 
 
 		 510 aa  170  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  32.74 
 
 		 462 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.25 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.89 
 
 		 494 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.11 
 
 		 494 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  32.19 
 
 		 510 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.19 
 
 		 515 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.66 
 
 		 509 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.1 
 
 		 479 aa  167  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.69 
 
 		 515 aa  167  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.12 
 
 		 511 aa  167  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  32.19 
 
 		 515 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  32.19 
 
 		 515 aa  166  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  32.19 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  31.97 
 
 		 510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  31.97 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  32.19 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.6 
 
 		 501 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.44 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.34 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.64 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.29 
 
 		 524 aa  160  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  27.92 
 
 		 517 aa  161  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.09 
 
 		 504 aa  160  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.42 
 
 		 502 aa  160  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.04 
 
 		 498 aa  160  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  31.7 
 
 		 504 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  31.7 
 
 		 504 aa  159  9e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  31.76 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.07 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.07 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  31.7 
 
 		 504 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  29.53 
 
 		 496 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  34.18 
 
 		 488 aa  157  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.14 
 
 		 490 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.13 
 
 		 506 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  32.29 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.24 
 
 		 507 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  30.48 
 
 		 512 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.63 
 
 		 514 aa  154  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  30.87 
 
 		 514 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  30.87 
 
 		 514 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  30.87 
 
 		 514 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  30.87 
 
 		 514 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.04 
 
 		 516 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.94 
 
 		 518 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  29.67 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.66 
 
 		 524 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.97 
 
 		 510 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.94 
 
 		 490 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.54 
 
 		 499 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.23 
 
 		 524 aa  151  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  30.66 
 
 		 514 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  32.94 
 
 		 506 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.43 
 
 		 499 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.54 
 
 		 514 aa  150  5e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  27.6 
 
 		 490 aa  150  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.87 
 
 		 499 aa  150  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  33.9 
 
 		 486 aa  150  7e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  30.05 
 
 		 499 aa  149  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.96 
 
 		 502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.3 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  29.4 
 
 		 519 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.19 
 
 		 521 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.36 
 
 		 501 aa  147  3e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.75 
 
 		 504 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.44 
 
 		 504 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  30.75 
 
 		 500 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  30.29 
 
 		 514 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  30.8 
 
 		 513 aa  146  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  30.43 
 
 		 513 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.1 
 
 		 519 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.41 
 
 		 499 aa  143  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  35.54 
 
 		 482 aa  143  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  29.33 
 
 		 496 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  30.29 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.58 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.29 
 
 		 529 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.83 
 
 		 525 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.31 
 
 		 524 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  29.89 
 
 		 496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>