More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0216 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0216  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  922    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2162  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.07 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1785  preprotein translocase, YajC subunit  43.66 
 
 		 467 aa  345  1e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1370  YjeF-related protein  43.42 
 
 		 496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1503  YjeF-related protein  41.56 
 
 		 466 aa  308  9e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00119463  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1688  YjeF-related protein  38.49 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0020  YjeF-related protein  36.05 
 
 		 490 aa  260  4e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0219  hypothetical protein  37.47 
 
 		 456 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0181  hypothetical protein  37.47 
 
 		 456 aa  237  3e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0198  hypothetical protein  37.02 
 
 		 456 aa  236  6e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1473  conserved hypothetical protein, possible sugar kinase  36.28 
 
 		 448 aa  221  3e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  30.75 
 
 		 498 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.64 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.08 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.59 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.18 
 
 		 513 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.02 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.24 
 
 		 492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.4 
 
 		 504 aa  163  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.02 
 
 		 514 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  32.82 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.78 
 
 		 515 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  30.07 
 
 		 492 aa  156  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.04 
 
 		 479 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.47 
 
 		 506 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.28 
 
 		 521 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.27 
 
 		 490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  29.82 
 
 		 511 aa  154  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.32 
 
 		 487 aa  153  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  29.26 
 
 		 514 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  31.15 
 
 		 510 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.84 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  29.26 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.37 
 
 		 519 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  29.26 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  29.26 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  29.26 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  30.93 
 
 		 510 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.93 
 
 		 515 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.28 
 
 		 490 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  32.6 
 
 		 486 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.09 
 
 		 524 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  30.93 
 
 		 515 aa  150  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  32.44 
 
 		 436 aa  149  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  30.93 
 
 		 515 aa  149  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  30.47 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  30.93 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.87 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  30.47 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.13 
 
 		 542 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.79 
 
 		 517 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  30.11 
 
 		 496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  30.7 
 
 		 515 aa  147  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  31.31 
 
 		 508 aa  146  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.45 
 
 		 492 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.21 
 
 		 528 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.41 
 
 		 499 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  25.59 
 
 		 499 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  27.25 
 
 		 499 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  30.9 
 
 		 496 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.5 
 
 		 494 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  30.02 
 
 		 517 aa  143  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  29.02 
 
 		 499 aa  143  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.91 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.05 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.47 
 
 		 515 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.39 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  29.31 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29 
 
 		 500 aa  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.39 
 
 		 501 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  29.08 
 
 		 504 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  26.99 
 
 		 493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  32.42 
 
 		 507 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  28.98 
 
 		 514 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  29.08 
 
 		 504 aa  140  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.43 
 
 		 532 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  29.22 
 
 		 519 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  27.59 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.85 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.82 
 
 		 494 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  30.09 
 
 		 481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  29.47 
 
 		 499 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.93 
 
 		 525 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.07 
 
 		 501 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  30.73 
 
 		 462 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.73 
 
 		 502 aa  137  6.0000000000000005e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.59 
 
 		 519 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.72 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.67 
 
 		 499 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.82 
 
 		 514 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  28.51 
 
 		 514 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.27 
 
 		 499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  28.21 
 
 		 502 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.44 
 
 		 499 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  29.8 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.82 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.61 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.6 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  28.48 
 
 		 510 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.09 
 
 		 533 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>