More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1370 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1370  YjeF-related protein  100 
 
 		 496 aa  992    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0216  hypothetical protein  43.42 
 
 		 454 aa  348  1e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1785  preprotein translocase, YajC subunit  41.77 
 
 		 467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2162  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.38 
 
 		 465 aa  319  6e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1688  YjeF-related protein  39.26 
 
 		 461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0020  YjeF-related protein  38.36 
 
 		 490 aa  306  8.000000000000001e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1503  YjeF-related protein  41.12 
 
 		 466 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00119463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.19 
 
 		 492 aa  227  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1473  conserved hypothetical protein, possible sugar kinase  39.02 
 
 		 448 aa  221  3e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  31.44 
 
 		 517 aa  212  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.98 
 
 		 509 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  33.06 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0219  hypothetical protein  35.74 
 
 		 456 aa  203  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.01 
 
 		 524 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0181  hypothetical protein  35.56 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0839486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  32.73 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.94 
 
 		 528 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  31.94 
 
 		 499 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.86 
 
 		 504 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.25 
 
 		 510 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0198  hypothetical protein  34.91 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.6 
 
 		 493 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.11 
 
 		 525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.27 
 
 		 517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.79 
 
 		 518 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.57 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.29 
 
 		 515 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.94 
 
 		 521 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.13 
 
 		 530 aa  186  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.75 
 
 		 513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  30.25 
 
 		 519 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.16 
 
 		 521 aa  183  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  30.95 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.9 
 
 		 499 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  32.73 
 
 		 492 aa  179  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.56 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  31.36 
 
 		 510 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.94 
 
 		 533 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  31.56 
 
 		 510 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  31.56 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.95 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.17 
 
 		 521 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  31.56 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  31.36 
 
 		 515 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.42 
 
 		 501 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.51 
 
 		 487 aa  177  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.23 
 
 		 499 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  31.36 
 
 		 515 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  31.36 
 
 		 515 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  30.15 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  32.05 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  32.05 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  32.05 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  32.05 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  31.16 
 
 		 510 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.57 
 
 		 490 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.03 
 
 		 506 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.82 
 
 		 520 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  31.85 
 
 		 514 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.03 
 
 		 533 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.39 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.23 
 
 		 501 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  31.66 
 
 		 522 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  30.26 
 
 		 496 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  32.94 
 
 		 488 aa  170  5e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  33.04 
 
 		 436 aa  169  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  29.33 
 
 		 514 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.27 
 
 		 511 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.89 
 
 		 532 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.09 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.75 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  29.65 
 
 		 512 aa  167  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  29.5 
 
 		 499 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.87 
 
 		 499 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.26 
 
 		 524 aa  166  8e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.78 
 
 		 499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  32.74 
 
 		 486 aa  162  9e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  29.72 
 
 		 514 aa  162  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  29.11 
 
 		 502 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.34 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  29.03 
 
 		 502 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.78 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.85 
 
 		 507 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  31.33 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  31.69 
 
 		 496 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.67 
 
 		 514 aa  161  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  30.99 
 
 		 506 aa  161  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.78 
 
 		 502 aa  161  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.57 
 
 		 514 aa  160  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  30.08 
 
 		 508 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.43 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.35 
 
 		 542 aa  159  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.13 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.4 
 
 		 501 aa  159  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.85 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.14 
 
 		 533 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.94 
 
 		 494 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  29.44 
 
 		 503 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  29.24 
 
 		 510 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6197  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.26 
 
 		 514 aa  156  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.327318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>