More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0181 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0181  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  906    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0198  hypothetical protein  96.93 
 
 
456 aa  886    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0219  hypothetical protein  98.46 
 
 
456 aa  894    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1473  conserved hypothetical protein, possible sugar kinase  66.08 
 
 
448 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1785  preprotein translocase, YajC subunit  39.53 
 
 
467 aa  298  2e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2162  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.66 
 
 
465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0020  YjeF-related protein  40.62 
 
 
490 aa  273  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1688  YjeF-related protein  39.69 
 
 
461 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1503  YjeF-related protein  38.62 
 
 
466 aa  267  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00119463  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0216  hypothetical protein  37.47 
 
 
454 aa  237  3e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1370  YjeF-related protein  34.7 
 
 
496 aa  192  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.79 
 
 
492 aa  170  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.83 
 
 
479 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.35 
 
 
513 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.06 
 
 
499 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  28.7 
 
 
499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.04 
 
 
499 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.25 
 
 
499 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.79 
 
 
499 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.29 
 
 
499 aa  146  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.45 
 
 
492 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.58 
 
 
509 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  27.17 
 
 
498 aa  144  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  29.51 
 
 
496 aa  143  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.84 
 
 
512 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.88 
 
 
510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.17 
 
 
500 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.65 
 
 
502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.05 
 
 
515 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  29.12 
 
 
517 aa  141  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.17 
 
 
498 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.8 
 
 
504 aa  139  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.51 
 
 
494 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  28.24 
 
 
492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.55 
 
 
490 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  29.05 
 
 
510 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  28.31 
 
 
512 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.72 
 
 
494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  28.04 
 
 
513 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.51 
 
 
494 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.31 
 
 
500 aa  133  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.66 
 
 
490 aa  133  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.35 
 
 
517 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  28.11 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.35 
 
 
494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  28.4 
 
 
514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  27.93 
 
 
511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.21 
 
 
515 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  28.4 
 
 
514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  28.4 
 
 
514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  30.21 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  28.4 
 
 
514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  30.21 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  29.11 
 
 
515 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  29.34 
 
 
515 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.63 
 
 
520 aa  131  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  27.31 
 
 
492 aa  131  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  29.11 
 
 
515 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  30.44 
 
 
515 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  30.21 
 
 
515 aa  130  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  28.16 
 
 
514 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.82 
 
 
506 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.77 
 
 
519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.31 
 
 
525 aa  127  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.61 
 
 
514 aa  126  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  29.37 
 
 
462 aa  126  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  26.5 
 
 
488 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.63 
 
 
521 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.41 
 
 
520 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  28.67 
 
 
504 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.35 
 
 
502 aa  125  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  25.74 
 
 
510 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.01 
 
 
524 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  29.32 
 
 
482 aa  124  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  28.44 
 
 
504 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  28.67 
 
 
504 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.54 
 
 
488 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  27.17 
 
 
508 aa  123  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  27.89 
 
 
436 aa  123  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.73 
 
 
524 aa  123  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.95 
 
 
530 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  26.52 
 
 
507 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2039  carbohydrate kinase YjeF-like protein  28.17 
 
 
490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  25.6 
 
 
481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.19 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.58 
 
 
532 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  27.43 
 
 
500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.59 
 
 
524 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.05 
 
 
504 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.81 
 
 
511 aa  120  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.46 
 
 
531 aa  120  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.85 
 
 
542 aa  120  7e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  24.79 
 
 
514 aa  120  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  26.29 
 
 
486 aa  119  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  26.95 
 
 
512 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  25.05 
 
 
499 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.79 
 
 
523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  26.1 
 
 
499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.24 
 
 
524 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.71 
 
 
514 aa  118  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>