More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2039 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2039  carbohydrate kinase YjeF-like protein  100 
 
 		 490 aa  959    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  64.68 
 
 		 479 aa  608  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.81 
 
 		 510 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.42 
 
 		 513 aa  252  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.61 
 
 		 521 aa  243  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.31 
 
 		 525 aa  243  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  36.38 
 
 		 498 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.52 
 
 		 524 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.45 
 
 		 520 aa  233  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.38 
 
 		 514 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.27 
 
 		 515 aa  230  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.77 
 
 		 502 aa  230  4e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  36.64 
 
 		 514 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.65 
 
 		 490 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.36 
 
 		 533 aa  224  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.62 
 
 		 530 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.5 
 
 		 511 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  35.25 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.86 
 
 		 519 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.95 
 
 		 509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.98 
 
 		 498 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  35.27 
 
 		 512 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.05 
 
 		 500 aa  212  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1145  YjeF-related protein-like protein  39.33 
 
 		 495 aa  209  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0478432  normal  0.107568 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.42 
 
 		 504 aa  209  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.87 
 
 		 524 aa  208  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.84 
 
 		 521 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  38.08 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.85 
 
 		 492 aa  207  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  37.87 
 
 		 488 aa  206  6e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  35.66 
 
 		 530 aa  206  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.39 
 
 		 515 aa  206  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.74 
 
 		 499 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.94 
 
 		 499 aa  203  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.1 
 
 		 516 aa  203  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  35.74 
 
 		 519 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  36.8 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.07 
 
 		 492 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.78 
 
 		 531 aa  200  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  40 
 
 		 436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.34 
 
 		 499 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.74 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  33.66 
 
 		 513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  35.18 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.88 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.36 
 
 		 524 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.72 
 
 		 492 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.3 
 
 		 501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.93 
 
 		 499 aa  197  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  35.43 
 
 		 499 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.47 
 
 		 501 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  39.41 
 
 		 531 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  33.2 
 
 		 490 aa  195  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.7 
 
 		 531 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.77 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  35.71 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.49 
 
 		 533 aa  194  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  34.6 
 
 		 499 aa  193  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.15 
 
 		 501 aa  193  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.71 
 
 		 517 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33 
 
 		 504 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  36.13 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  26.95 
 
 		 499 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  35.26 
 
 		 492 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  34.82 
 
 		 496 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  26.92 
 
 		 499 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.89 
 
 		 524 aa  189  7e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.25 
 
 		 490 aa  189  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  39.96 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.69 
 
 		 507 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.21 
 
 		 500 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  32.02 
 
 		 512 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  34.94 
 
 		 514 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  35.7 
 
 		 510 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.39 
 
 		 492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  36.69 
 
 		 499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 		 500 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.42 
 
 		 507 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  37.41 
 
 		 462 aa  183  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  33.27 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.53 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.75 
 
 		 512 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  39.87 
 
 		 502 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.46 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.21 
 
 		 532 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.14 
 
 		 502 aa  182  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  32.63 
 
 		 524 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 507 aa  180  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.66 
 
 		 506 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.22 
 
 		 528 aa  179  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.45 
 
 		 556 aa  180  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  33.33 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.46 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.03 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  34.03 
 
 		 510 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  36.27 
 
 		 499 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1683  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.22 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.09 
 
 		 510 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.67 
 
 		 512 aa  177  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  34.03 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>