More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0742 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0742  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 296 aa  544  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5173  carbohydrate kinase, YjeF related protein  62.37 
 
 		 298 aa  315  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235734  normal  0.234925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4707  carbohydrate kinase, YjeF related protein  61.67 
 
 		 298 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5246  carbohydrate kinase, YjeF related protein  62.37 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3050  carbohydrate kinase, YjeF related protein  64.01 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0182  hypothetical protein  50.18 
 
 		 293 aa  221  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3700  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.49 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.562936  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3037  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.37 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.974968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.58 
 
 		 515 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1301  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.26 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0119511  decreased coverage  0.000369396 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.66 
 
 		 510 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.96 
 
 		 516 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0119  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.88 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  36.5 
 
 		 512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.68 
 
 		 511 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  33.83 
 
 		 512 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  34.31 
 
 		 522 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.14 
 
 		 524 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.59 
 
 		 524 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.33 
 
 		 528 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.04 
 
 		 520 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.45 
 
 		 519 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37 
 
 		 512 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.3 
 
 		 556 aa  118  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.85 
 
 		 499 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  36.75 
 
 		 498 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.1 
 
 		 513 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.06 
 
 		 509 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.47 
 
 		 521 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.86 
 
 		 514 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.93 
 
 		 504 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  36.9 
 
 		 519 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.14 
 
 		 533 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  33.58 
 
 		 517 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.22 
 
 		 533 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.71 
 
 		 556 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.97 
 
 		 516 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  39.11 
 
 		 497 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2235  hypothetical protein  32.44 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.45 
 
 		 546 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  33.33 
 
 		 524 aa  109  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.23 
 
 		 512 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.07 
 
 		 530 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.91 
 
 		 528 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.28 
 
 		 501 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.03 
 
 		 506 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.83 
 
 		 521 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0510  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.48 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0209732  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.41 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  26.12 
 
 		 499 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.6 
 
 		 495 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.87 
 
 		 511 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.41 
 
 		 498 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  34.55 
 
 		 514 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.97 
 
 		 508 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.34 
 
 		 490 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.85 
 
 		 511 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.12 
 
 		 493 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.83 
 
 		 500 aa  105  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.77 
 
 		 487 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  26.37 
 
 		 499 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.84 
 
 		 512 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  36.08 
 
 		 499 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.02 
 
 		 520 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  38.67 
 
 		 534 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.21 
 
 		 530 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.96 
 
 		 487 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.95 
 
 		 521 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  31.53 
 
 		 493 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  35.27 
 
 		 499 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.58 
 
 		 507 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.99 
 
 		 530 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.06 
 
 		 533 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  33.45 
 
 		 493 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  35.84 
 
 		 436 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.01 
 
 		 524 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.74 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19611  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  38.79 
 
 		 533 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  37.27 
 
 		 531 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  36.3 
 
 		 499 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.79 
 
 		 531 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31 
 
 		 525 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.34 
 
 		 502 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.46 
 
 		 479 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.74 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.270642  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  34.03 
 
 		 504 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.23 
 
 		 500 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.53 
 
 		 492 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.98 
 
 		 517 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  38.89 
 
 		 495 aa  99.8  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  30.94 
 
 		 499 aa  99.8  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  34.47 
 
 		 510 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  34.03 
 
 		 504 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.89 
 
 		 499 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  29.89 
 
 		 511 aa  99.4  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1502  hypothetical protein  43.33 
 
 		 509 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16359  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.7 
 
 		 509 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.22 
 
 		 496 aa  99.4  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  33.68 
 
 		 504 aa  99  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>